派森诺多组学项目文章：IF=12.5！60%CO₂当饭吃，这藻如何进化出四维金钟罩?

工业烟气是碳排放的"重灾区"，对大多数微藻而言，10% CO₂已是生存极限，超过这个浓度，生长和固碳效率双双"崩盘"。

但大自然总有例外。

近日，华南农业大学团队从广西南丹高砷矿区土壤中，分离出一株"硬核"藻株——空星藻Coelastrum sp. GX03。它不仅能耐受60% CO₂，还能在这种“毒气室”级别的高碳环境中保持强劲固碳能力，生物量产率和固碳速率比同类藻株高出100%以上。

这项研究近日发表于化工顶刊Chemical Engineering Journal（最新IF12.5），并首次绘制了空星藻属染色体水平基因组图谱，为工业烟气生物固碳和油脂型藻生物质开发提供了新种质与理论依据。

本研究的基因组denovo、比较基因组、转录组及代谢组的测序和分析工作均由上海派森诺生物科技股份有限公司完成。

英文标题：Genetic and metabolic mechanisms of oleaginous Coelastrum sp. GX03 to cope with extremely high CO₂

中文标题：油脂型空星藻GX03应对极端高浓度CO₂的遗传与代谢机制

发表期刊：Chemical Engineering Journal

影响因子：12.5

发表时间：2026年

合作单位：华南农业大学

DOI：10.1016/j.cej.2026.179074

研究背景

微生物藻类的光合固碳是实现碳捕集、利用与封存（CCUS）的重要途径。微藻的光合效率比陆生植物高10–50倍，约吸收全球光合生物固定CO₂总量的50%，是大规模CCUS应用的理想候选者。然而，工业烟气中CO₂浓度极高——燃煤电厂排放气含7–27%、高炉可达60%、煤化工和发酵行业甚至高达99%。当CO₂浓度超过10%时，绝大多数微藻的生长和固碳效率会受到抑制，只有少数藻株能耐受50%以上的CO₂。因此，筛选兼具高CO₂耐受性和强固碳效率的藻株，对于推动该技术的工业化应用至关重要。

本研究从广西南丹砷矿表层土壤中分离筛选获得Coelastrum sp. GX03，该藻株在60% CO₂条件下仍能保持较强固碳能力。此前，空星藻属在超高CO₂浓度下的耐受策略尚未见报道。

研究背景

研究材料与方法

1. 实验材料：从广西南丹砷矿表层土壤分离获得GX01（Desmodesmus sp.）、GX02（Chlamydomonas sp.）、GX03（Coelastrum sp.），以及实验室保藏的Chlorella sp. HH01作为对照菌株。

2. 测序与检测平台：

• 基因组：PacBio Revio＋Illumina NovaSeq＋Hi-C；

• 转录组：Illumina；

• 代谢组：ACQUITY UPLC HSS T3色谱柱分离，Thermo Orbitrap Exploris 120质谱仪检测

3. 分析内容：染色体水平基因组组装与注释、比较基因组与进化分析、转录组测序、非靶向代谢组检测及转录组－代谢组联合分析。

研究结果

1. GX03的筛选与超高CO2耐受性评价

经酸耐受性（pH 3.0、4.5、7.6）和60% CO₂耐受性筛选，GX03表现出最稳定的耐受能力，其OD680和Fv/Fm值显著高于GX01和GX02。在60% CO₂条件下，GX03的生物量产率和净生物量CO2固碳速率（CSR）分别为290±12 mg L-1 d-1和517±25 mg CO₂ L-1d-1，较GX01和GX02分别高出104%和109%。在已报道的耐超高CO₂（>50%）微藻中，GX03的固碳能力处于领先水平，且其脂肪酸组成以C16–C18为主，符合生物柴油原料标准。

表1. 不同处理条件下藻类生物量、脂质产量和二氧化碳封存速率

2. 染色体级别基因组组装与注释

为阐明其遗传机制，本研究完成了空星藻属首个染色体级别基因组组装。基因组大小111 Mb，初始组装N50为3.95 Mb，Q20碱基比例99.09%。经Hi-C辅助支架搭建后，约109 Mb（97.50%）的序列成功锚定到19条染色体上，支架N50达6.21 Mb。共预测12,258个蛋白编码基因，平均基因长度4.39 kb，94.31%的基因获得功能注释。GO注释显示基因主要富集于结合、催化活性、转运活性等分子功能；KEGG注释显示主要富集于碳水化合物、氨基酸、能量和脂质代谢通路。

图1. GX03基因组特征与比较基因组分析

3. 比较基因组学分析

与16种近缘微藻的比较分析显示，GX03拥有8,622个基因家族，其中94个为独特基因家族，包含297个独特基因（如热激蛋白、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶等）。系统发育分析表明GX03与Scenedesmus sp. NREL约在3.2亿年前分歧。

GX03表现出1,173个基因家族扩张（涉及3,574个基因）和3,270个基因家族收缩。扩张基因家族显著富集于半乳糖代谢、过氧化物酶体、ABC转运蛋白和氰基氨基酸代谢等通路；收缩基因家族则富集于阴离子转运和乙烯激素介导的信号通路，提示该藻在进化中精简了部分环境感知和营养摄取能力，以优先保障核心代谢通路的能量效率和特化。

此外，通过Ks分布分析，GX03在约1.035亿年前和1,626万年前经历了两次全基因组复制（WGD）事件。近期WGD保留了RbcLβ、TXNDC5、ADI（胍丁胺脱亚氨酶）等关键基因家族，其中ADI在缓解胞内酸化和调控多胺代谢中发挥重要作用。

图2. 不同CO₂浓度对GX03生长和生理的影响

4. 不同CO₂浓度对GX03的影响

60% CO₂（HC）条件下，GX03生长受到一定抑制，生物量产率比LC和MC组分别降低30.2%和23.1%，比生长速率显著低于对照。但细胞宽度和体积显著增大，比表面积呈相反趋势。HC组光合速率和呼吸速率显著升高，但Fv/Fm、Pi_Abs和相对电子传递速率（ETR）在培养后期显著低于对照，表明极端高CO₂对光合机构造成了一定损伤。生化组成方面，HC组脂质含量显著降低，淀粉和可溶性蛋白含量升高。固碳速率（CSR）在HC条件下为489±46 mg L-1 d-1，较LC组降低25.2%，但在超高CO₂藻株中仍处于较高水平。

图3. 不同CO₂浓度对GX03生长与生理特征的影响

5. 转录组分析揭示“四维防御”的分子基础

转录组PCA显示三组样本聚类清晰，HC/MC比较组共鉴定出741个上调和1,198个下调的差异表达基因（DEGs）。核心发现包括：光系统增强——光合作用-天线蛋白通路13个DEG全部上调，psa和psb家族基因表达增强以维持电子传递；碳氮代谢重编程——丙酮酸代谢和精氨酸生物合成通路中PDH、PEPCK、GS、ASS等基因上调，驱动氮向谷氨酰胺/天冬酰胺同化；pH稳态——液泡膜质子泵和质膜H⁺-ATP酶基因未显著上调，提示GX03不依赖耗能的H⁺外排，而是通过更节能的方式缓解胞内酸化；氧化还原平衡——PRDX6基因上调11.9倍，APX活性激增319%，同时MDA含量下降，抗氧化网络高效启动。

图4. 不同CO₂浓度下GX03的光合、抗氧化与固碳酶响应

图5. 不同CO₂浓度下GX03的转录组响应

6. 代谢组分析

代谢组PCA显示各组分离显著，HC/MC组共筛选出181个上调和31个下调的差异代谢物，显著富集于氨基酸生物合成、TCA循环、精氨酸/脯氨酸代谢及ABC转运蛋白等通路。关键代谢物变化包括：TCA循环中间产物（草酰乙酸、柠檬酸、异柠檬酸）和氨基酸（L-谷氨酰胺、L-天冬酰胺）大量积累；亚精胺激增71.9倍，腐胺上调5.5倍，多胺通过清除ROS、稳定膜结构和调节渗透压协同增强抗逆；16种甘油磷脂上调9.3–74.9倍，脂类代谢发生显著重塑；UDP-半乳糖上调194倍，而棉子糖下降92%，提示碳同化速率超过下游代谢能力，碳流被导向保护性储备。

图6. GX03在不同CO₂浓度下的代谢组响应

7. 转录组与代谢组联合分析

联合分析表明，丙氨酸/天冬氨酸/谷氨酸代谢和乙醛酸/二羧酸代谢通路在HC/MC组共同富集。在碳过剩条件下，藻细胞通过GS和ASS将氮同化为谷氨酰胺/天冬酰胺以减少游离氮损失；苹果酸合酶上调有助于消耗H⁺；AST和柠檬酸合酶基因上调表明TCA循环增强。这些结果共同揭示了GX03通过"四维防御机制"——光系统增强、碳氮代谢重编程、pH与渗透稳态、氧化还原平衡——应对极端CO₂胁迫的独特策略。与其他耐高CO₂微藻相比，GX03的核心创新在于以最小能量消耗实现碳过载管理，其进化获得的多胺生物合成能力可能对此独特耐受性做出了重要贡献。

总结

GX03具有独特的遗传组成，其进化历程中的基因家族收缩和功能增强（基因家族扩张、两次全基因组复制）赋予了其卓越的CO₂耐受性。该藻株通过优化光合机制、调节碳氮通量、重塑膜脂结构，并上调解毒、DNA修复和蛋白稳态相关基因，同时下调产酸发酵通路、增强多胺生物合成，形成了对高碳低pH胁迫的协同响应。本研究为微藻应对极端CO₂浓度提供了全新视角，未来可通过优化培养条件、验证多胺合成关键基因（如ADI）及基因编辑手段进一步提升藻株生产力，推动其在工业烟气固碳中的实际应用。

原文引用：Zhang, M., Liao, X., Li, Y., Wang, N., Wang, L., Huang, Y., Chen, C., Duan, Y., Wang, J., & He, H. (2026). Genetic and metabolic mechanisms of oleaginous Coelastrum sp. GX03 to cope with extremely high CO₂. Chemical Engineering Journal, 544, 179074.

供稿  | 技术服务中心

编辑  | 市场部