Day5 郭东琪

拿小本本记下啦

(1)R的规范赋值符号是<-,也可以用=代替
(2)在Console 控制台输入命令,相当于Linux的命令行
(3)R的代码都是带括号的,括号必须是英文的。
(4)显示工作路径 getwd()
(5)向量是由元素组成的,元素可以是数字或者字符串。
用不到的知识:R语言的对象有五种最基本的类型,即,字符型(character)、数值型(numeric,包括小数)、整型(integer)、复数型(complex)以及逻辑型(logical,TRUE/FALSE)
(6)表格在R语言中称为数据框_
(7)别只复制代码,要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时,除了百度/谷歌搜索以外,用这个命令查看帮助:?read.table,调出对应的帮助文档,翻到example部分研究一下。
(8)数据类型
向量(vector)
矩阵(Matrix)
数组(Array)
数据框(Data frame)
列表(List)

笔记

向量

标量和向量的区分

标量:一个元素组成的变量
向量:多个元素组成的变量
补充:向量是有顺序的
赋值示例代码

x<- c(1,2,3) #常用的向量写法,意为将x定义为由元素1,2,3组成的向量。x
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数x
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数(注意是逗号不是分号)x
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次x

x被赋值了4次,每赋值一次都会将上一次的x值覆盖掉

从向量中提取元素

提取元素示例代码

#这里的x是你刚才赋值的变量名,根据自己的情况来修改
#根据元素位置
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法,除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c(1,2,5)中的元素

数据框

(1)读取本地数据

read.table (file ='huahua.txt',sep='\t,header =T)
a<-read.table (file ='huahua.txt', sep='t', header =T)

(2)查看行名和列名、行数和列数

colnames(a) #查看列名
rownames(a) #查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
dim(a)#几行几列

(3)数据框的导出

write.table(a,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号)

(4)变量的保存与重新加载

#这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(a,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

(5)提取元素

a[x,y]#第x行第y列
a[x,]#第x行
a[,y]#第y列
a[y] #也是第y列
a[a:b]#第a列到第b列
a[c(a,b)]#第a列和第b列
a$列名#也可以提取列(优秀写法,支持Tab自动补全哦,不过只能提取一列)

(6)【选修部分】直接使用数据框中的变量

plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width)

iris:这是R中自带的一个经典数据集,包含150个不同鸢尾花样本的信息。这些样本分为三类:Setosa、Versicolor和Virginica。每个样本中记录了四个特征:花萼长度、花萼宽度、花瓣长度和花瓣宽度,还有样本所属的鸢尾花种类。

iris$Sepal.Length:这是iris数据集中花萼长度的列。它提取出所有样本的花萼长度数据,作为散点图的横坐标。

iris$Sepal.Width:这是iris数据集中花萼宽度的列。它提取出所有样本的花萼宽度数据,作为散点图的纵坐标。

plot():这是R中的一个基本绘图函数,用于生成各种类型的图形。这里调用plot()函数会生成一个以irisSepal.Length为x轴、irisSepal.Length为x轴、irisSepal.Lengthx轴、irisSepal.Width为y轴的散点图。散点图通常用于展示两个变量之间的关系。
脚本窗口
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跑代码的图
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