Day4 郭东琪

宝藏资源

R for Data Science (2e)
ggplot2: Elegant Graphics for Data Analysis (3e)
Tidy Modeling with R

备份

坚果云、iCloud云盘等（有点贵，我在用百度云的同步空间）

小技巧

tab键补全文件名
标点符号要用英文

准备工作

查看你的电脑用户名是中文还是英文

打开桌面一个文件夹

如果是中文要参考生信星球“当Rstudio杠上中文用户名”推文

下载R、Rstudio

官网或网盘，Windows还需要下载Rtools

认识R与R Studio

R是一种编程语言
界面简陋，通常不直接使用，而是用图形界面的Rstudio

设置字体大小

爱护眼睛

两行代码跑跑试试手

plot(rnorm(50))
boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))

R语言基本操作

Rproject管理工作目录

什么是工作目录(working directory , wd)

文件读取、保存的默认位置

方法1 setwd

setwd("D://BaiduSyncdisk//单细胞学习小组")  #位置复制粘贴换成自己的，Windows要双斜杠//

方法2 Rproject

在Rstudio右上角-file-new project-new directory-new project-起名字（将作为文件夹名和.rproj文件的前缀）-选择位置-create project

以后再次使用时，只需要双击打开.Rproj文件，会触发一系列操作，如:
打开Rstudio
自动设置工作目录为.Rproj所在的目录
加载上次关闭时的工作空间（.RData）
恢复上次关闭时的控制台历史命令（.Rhistory）
打开上次关闭时打开的脚本（.R）
打开R脚本的正确操作：打开Rproject后从右下角文件面板单击打开脚本，不要直接在文件夹里双击脚本，这样工作目录没有用rproject管理。

显示文件列表（相当于linux的ls）

dir()

###加减乘除

变量赋值

Alt加上减号， 赋值后，变量会显示在右上角的框，Environment里的Value列表里

删除变量

rm()
rm(list = ls())#清空所有变量 

列出历史命令

方法1 history()

方法2 右上角的history标签

清空控制台

快捷键Ctrl＋L
rm(list = ls())是清空Environment里的Value列表

思维导图