Illumina（ILMN）vs Thermo Fisher Scientific（TMO）— 事業成長力を徹底比較する

【ゲノム解析の専門王者か、ライフサイエンス総合プラットフォームか ― 研究・診断インフラ2社を比べる】

記録日：2026年7月2日

本記事では、ゲノム解析装置・試薬に特化した Illumina と、分析機器、試薬、診断、ラボ用品、CDMO・臨床試験支援まで広く展開する Thermo Fisher Scientific を比較します。

IlluminaはNasdaq上場、ティッカーILMN。Thermo Fisher ScientificはNYSE上場、ティッカーTMOです。いずれも米国会計基準（US GAAP）、12月決算です。

Illuminaは、NovaSeq X、NextSeq、MiSeq、DRAGEN、Connected Multiomicsなどを軸に、NGS（次世代シーケンシング）とマルチオミクスへ展開する企業です。2026年1月にはSomaLogic買収を完了し、プロテオミクス領域も取り込みました。

Thermo Fisher Scientificは、Life Sciences Solutions、Analytical Instruments、Specialty Diagnostics、Laboratory Products and Biopharma Servicesの4セグメントを持つ、ライフサイエンス業界の総合インフラ企業です。2026年3月にはClario買収を完了し、臨床試験データ・エンドポイント支援も強化しています。

株価・時価総額・PERは、2026年7月2日UTC前後に確認できた市場データをもとにしています。市場規模は、出典が確認できた数値のみ記載します。

筆者の注目ポイント

注目度：Illumina ★★★★☆ / Thermo Fisher Scientific ★★★★☆

筆者は今回は  Thermo Fisher Scientificにやや強い関心 を持っています。

理由は、IlluminaのNGSにおけるポジションは非常に強い一方、Thermo Fisherは研究・診断・製薬開発・分析機器・ラボ消耗品・CDMO・CROまで広く押さえ、顧客の研究開発バリューチェーン全体に入り込んでいるためです。

ただし、Illuminaもかなり面白い局面です。GRAIL分離後に本業へ集中し、SomaLogic買収でマルチオミクスへ広げ、NovaSeq Xの需要拡大と中国以外の成長が見えています。

ざっくり言うと、

• Illumina：NGS・ゲノム解析の専門王者

• Thermo Fisher：ライフサイエンスの総合プラットフォーム

という比較です。

① 現在の株価・バリュエーション比較

Illumina

• ティッカー：ILMN

• 上場市場：Nasdaq

• 株価：183.89ドル

• 時価総額：約283億ドル

• PER：33.0倍前後

• EPS：5.58ドル前後

• 配当利回り：なし

• 決算期：12月

• 会計基準：US GAAP

Illuminaは、配当ではなく成長投資・自社株買いで見る銘柄です。2026年1Qでは、取締役会が追加で15億ドルの自社株買いを承認しています。

PERはThermo Fisherよりやや高い水準です。これは、NGS市場の高成長、SomaLogic買収によるマルチオミクス展開、GRAIL分離後の利益率改善期待を織り込んでいる面があります。

Thermo Fisher Scientific

• ティッカー：TMO

• 上場市場：NYSE

• 株価：513.33ドル

• 時価総額：約1,915億ドル

• PER：28.2倍前後

• EPS：18.19ドル前後

• 配当利回り：低め

• 決算期：12月

• 会計基準：US GAAP

Thermo Fisherは、時価総額でIlluminaの約7倍規模の巨大企業です。成長株というより、ライフサイエンス業界全体の設備投資・研究開発・製薬開発需要を広く取り込む「研究インフラ株」に近い存在です。

配当利回りは高くありません。資本配分の中心は、M&A、自社株買い、事業ポートフォリオの組み替えです。

② 直近決算の比較

Illumina：2026年12月期 第1四半期

Illuminaの2026年1Qは、売上・利益率ともに改善しました。

• 売上高：10.91億ドル

• 前年同期比：4.8％増

• GAAP粗利益率：66.1％

• Non-GAAP粗利益率：68.2％

• GAAP営業利益：2.09億ドル

• GAAP営業利益率：19.2％

• Non-GAAP営業利益：2.39億ドル

• Non-GAAP営業利益率：21.9％

• GAAP希薄化後EPS：0.87ドル

• Non-GAAP希薄化後EPS：1.15ドル

• 営業キャッシュフロー：2.89億ドル

• フリーキャッシュフロー：2.51億ドル

• 現金・短期投資：11.6億ドル

会社側は2026年通期見通しとして、売上高45.2億〜46.2億ドル、Non-GAAP営業利益率23.4〜23.6％、Non-GAAP希薄化後EPS5.15〜5.30ドルを示しています。

Thermo Fisher Scientific：2026年12月期 第1四半期

Thermo Fisherの2026年1Qは、Clarioの取り込みもあり、売上が増加しました。

• 売上高：110.1億ドル

• 前年同期比：6％増

• オーガニック売上成長率：1％

• GAAP希薄化後EPS：4.43ドル

• Adjusted EPS：5.44ドル

• GAAP営業利益：18.6億ドル

• GAAP営業利益率：16.9％

• Adjusted営業利益：24.0億ドル

• Adjusted営業利益率：21.8％

Thermo Fisherのポイントは、単なる売上規模だけではありません。Life Sciences Solutions、Analytical Instruments、Specialty Diagnostics、Laboratory Products and Biopharma Servicesの4セグメントを通じて、研究初期から臨床試験、診断、製造まで幅広くカバーしています。

③ 事業構造・中期計画の比較

Illuminaの事業構造

Illuminaは、DNA・RNA解析の中核技術であるシーケンシングに強い企業です。

主な製品・サービスは以下です。

• NovaSeq Xシリーズ

• NovaSeq 6000

• NextSeqシリーズ

• MiSeqシリーズ

• iSeq

• シーケンシング試薬・フローセル

• Infiniumアレイ

• DRAGEN Bio-IT Platform

• Illumina Connected Multiomics

• StrataMap Spatial Solution

• SomaLogic由来のSomaScanプロテオミクス技術

Illuminaの収益は、装置販売だけでなく、装置稼働後に継続的に発生する消耗品・試薬・データ解析ソフトウェアに支えられています。

2026年1月にはSomaLogic買収を完了しました。これにより、ゲノムだけでなく、タンパク質解析を含むマルチオミクスへ領域を広げています。

Thermo Fisher Scientificの事業構造

Thermo Fisherは、ライフサイエンス業界の総合商社・メーカー・サービス企業を合わせたような存在です。

主な4セグメントは以下です。

• Life Sciences Solutions

• Analytical Instruments

• Specialty Diagnostics

• Laboratory Products and Biopharma Services

代表的なブランド・事業群は以下です。

• Thermo Scientific

• Applied Biosystems

• Invitrogen

• Gibco

• Ion Torrent

• Fisher Scientific

• Unity Lab Services

• PPD

• Patheon

• Clario

Thermo Fisherは、試薬、分析機器、質量分析、クロマトグラフィー、電子顕微鏡、診断キット、ラボ用品、バイオ医薬品製造支援、臨床試験支援まで広く展開します。

2026年3月にClario買収を完了したことで、臨床試験におけるエンドポイントデータ、患者データ取得、試験効率化の領域も強化されました。

④ 2社のビジネス戦略の違い

Illumina：NGSの深掘りからマルチオミクスへ

Illuminaの戦略は、NGSの圧倒的な installed base を活かしながら、用途を研究から臨床、創薬、がん、MRD、空間解析、プロテオミクスへ広げることです。

強みは、シーケンサー、消耗品、解析ソフトウェア、データ互換性、既存顧客基盤が一体化している点です。

一方で、Roche、Oxford Nanopore、PacBio、MGI/BGI、Thermo Fisherなどが周辺から競争を仕掛けています。特に、ロングリードや低コストシーケンス、臨床向けワークフローでは競争が強まっています。

Thermo Fisher：研究開発バリューチェーン全体を押さえる

Thermo Fisherの戦略は、顧客の研究・開発・製造・診断のあらゆる場面に入り込むことです。

研究者が試薬を買う、製薬会社がバイオプロセス材料を使う、分析機器を導入する、臨床試験を外部委託する、CDMOで製造する。こうした流れの複数地点で収益機会を持っています。

これは非常に強い一方で、事業範囲が広すぎるため、景気、バイオテック資金調達、製薬R&D、政府研究予算、M&A統合、為替、規制の影響を幅広く受けます。

ざっくり言うと

• Illumina：1つの巨大技術プラットフォームを深く掘る

• Thermo Fisher：研究・診断・製造のサプライチェーン全体を広く押さえる

という違いです。

⑤ 市場規模（TAM）と成長性

NGS市場

Grand View Researchによると、世界の次世代シーケンシング市場は、2025年に113億ドル、2026年に133億ドル、2033年に423億ドルへ拡大すると見込まれています。2026〜2033年のCAGRは18.0％です。

対象範囲は、NGSプラットフォーム、消耗品、アプリケーション、ワークフロー、エンドユーザーなどです。

Illuminaにとって、これは主戦場そのものです。特に、がん、臨床検査、創薬、希少疾患、MRD、感染症、農業・食品などへの応用拡大が成長ドライバーになります。

ライフサイエンスツール市場

Grand View Researchによると、世界のライフサイエンスツール市場は、2025年に1,843億ドル、2026年に2,026億ドル、2033年に4,010億ドルへ拡大すると見込まれています。2026〜2033年のCAGRは10.2％です。

対象範囲は、細胞生物学、プロテオミクス、PCR/qPCR、細胞培養、液体クロマトグラフィー、政府・大学、医療などです。

Thermo Fisherは、この広い市場の中心プレイヤーです。さらに、分析機器市場では、Grand View Researchが2026年606億ドル、2033年905億ドル、CAGR5.9％と推計しています。

両社の市場ポジション

Illuminaは、NGSという高成長市場の中核企業です。市場が伸びるほど、装置更新、消耗品、データ解析需要を取り込みやすい構造です。

Thermo Fisherは、NGSだけでなく、ライフサイエンスツール、分析機器、診断、ラボ用品、製薬開発支援まで含む、より広いTAMを持ちます。

⑥ 各社の優位性と参入障壁

Illuminaの優位性

Illuminaの優位性は、NGSのエコシステムです。

• 高いシーケンサー設置基盤

• NovaSeq Xを中心とした高スループット製品

• 試薬・消耗品の継続収益

• DRAGENによる解析ソフトウェア

• 研究者・臨床検査機関における標準性

• SomaLogic買収によるプロテオミクス拡張

• NGSワークフロー全体の使い慣れた環境

参入障壁は、技術、精度、顧客のワークフロー、データ互換性、規制対応、消耗品の継続利用です。

ただし、Rocheの新型シーケンサー投入、ロングリード勢の拡大、低コスト化の進展により、以前ほど“完全に一強”とは言いにくくなっています。

Thermo Fisherの優位性

Thermo Fisherの優位性は、規模と品揃えです。

• 年間売上450億ドル超の規模

• 4つの主要セグメント

• 研究・診断・製薬開発・製造を横断する顧客接点

• Fisher Scientificの販売チャネル

• Applied Biosystems、Invitrogen、Gibco、Thermo Scientificなどのブランド群

• PPI Business Systemによる継続改善

• M&Aによる周辺領域の取り込み

• PPD、Patheon、Clarioを通じた製薬開発支援

参入障壁は、販売網、製品ポートフォリオ、顧客との購買関係、サービス体制、規制対応、M&A統合力です。

単一技術の爆発力ではIlluminaに劣りますが、顧客の研究開発予算の複数項目を取り込める点が強いです。

どちらの堀が深いか

堀の性質が違います。

• Illumina：NGS技術・ワークフロー・消耗品の堀

• Thermo Fisher：規模・販売網・総合提案・M&A統合の堀

深さだけで見るとIlluminaも強いですが、広さと耐久性ではThermo Fisherに分があると感じます。

⑦ 今後3年間の事業環境シナリオ

追い風シナリオ

Illuminaでは、NovaSeq Xの更新需要、臨床シーケンス、MRD、がん領域、SomaLogic由来のプロテオミクス、空間解析が伸びるケースです。中国以外の地域で成長が続けば、利益率改善も進みやすくなります。

Thermo Fisherでは、バイオテック資金調達が回復し、製薬R&D、バイオプロセス、分析機器、臨床試験支援、CDMO需要が同時に改善するケースです。Clario統合が進めば、臨床開発支援の幅も広がります。

基本シナリオ

Illuminaは、NGS市場の成長を取り込みながらも、中国・競争・価格低下の影響を受けつつ、NovaSeq Xと消耗品で堅調に伸ばす展開です。

Thermo Fisherは、オーガニック成長は緩やかでも、M&A、PPIによる効率化、製薬・診断・研究予算の分散された需要で安定成長を目指す展開です。

逆風シナリオ

Illuminaでは、新規競合の台頭、装置更新の遅れ、価格下落、臨床用途の規制・償還の遅れ、中国需要の弱さが逆風になります。

Thermo Fisherでは、バイオテック資金調達の低迷、政府研究予算の抑制、製薬会社のR&D慎重化、M&A統合負担、為替・金利・地政学リスクが重くなります。

⑧ 筆者がThermo Fisher Scientificに注目する理由

1. 顧客の研究開発バリューチェーン全体に入り込んでいる

Thermo Fisherは、研究者が試薬を買うところから、分析機器、診断、臨床試験、製薬製造支援まで広く関与します。

1つの製品が外れても、別の領域で顧客接点を維持できる点が強みです。

2. M&Aで周辺領域を広げ続けている

Thermo Fisherは、PPD、Patheon、Olink、Clarioなど、研究・臨床・製造の周辺領域をM&Aで取り込んできました。

2026年3月のClario買収は、臨床試験のエンドポイントデータ領域を強化する動きです。製薬会社の臨床開発に深く入り込めるほど、顧客との関係は強くなります。

3. 単一技術リスクが低い

IlluminaはNGSに強く、そこが魅力です。ただし、NGS内の競争や技術転換の影響を受けやすい構造でもあります。

Thermo Fisherは幅広い領域に分散しているため、特定技術の陳腐化リスクを抑えやすいです。

反論ポイント：Illuminaの専門特化は強烈

とはいえ、IlluminaのNGSにおける存在感は非常に大きいです。

ゲノム解析が臨床・創薬・がん・希少疾患へ広がるほど、Illuminaの装置・消耗品・解析基盤の価値は増します。

高成長テーマをピンポイントで取りたいなら、Illuminaのほうがわかりやすい銘柄です。

⑨ 両社の競合マップ（6社）

直接競合

• Roche

  • 新型シーケンサーや診断領域でIllumina、Thermo Fisher双方と重なる。

• Danaher

  • Cytiva、Beckman Coulter、SCIEXなどを通じてライフサイエンス・診断・分析機器で競合。

広義の競合

• Agilent Technologies

  • 分析機器、診断、ライフサイエンス試薬でThermo Fisherと競合。Illumina CEOの前職企業でもある。

• Bruker

  • 質量分析、ライフサイエンス機器、プロテオミクス周辺で競合。

海外 or 代替競合

• Oxford Nanopore Technologies

  • ロングリード・リアルタイムシーケンスでIlluminaの代替技術を提供。

• PacBio

  • 高精度ロングリード領域でIlluminaと競合。

⑩ それぞれのリスク要因

Illuminaのリスク

• NGS競争の激化

• Roche、Oxford Nanopore、PacBio、MGI/BGIなどの台頭

• 中国市場の弱さ

• 装置更新サイクルの遅れ

• 研究予算・臨床検査予算の変動

• 価格低下と消耗品マージンへの圧力

• SomaLogic統合とマルチオミクス展開の不確実性

• GRAIL分離後の成長ストーリー再構築

Thermo Fisher Scientificのリスク

• バイオテック資金調達の低迷

• 政府研究予算の抑制

• 製薬会社のR&D投資減速

• M&A統合リスク

• Clario買収後の収益化・統合負担

• 為替変動

• 中国・欧州・米国規制の変化

• 事業が広いことによる複雑性

共通のリスク

• ライフサイエンス研究予算の変動

• 医療・診断規制

• データ・個人情報保護

• サイバーセキュリティ

• 価格競争

• サプライチェーン混乱

• 地政学リスク

• M&A後の統合失敗

⑪ 読者の関心軸別まとめ

成長性重視

成長性重視なら、Illuminaのほうがテーマ性は強いです。NGS市場のCAGR18.0％、臨床応用、マルチオミクス、NovaSeq Xの更新需要が見どころです。

安定性重視

安定性重視なら、Thermo Fisherです。事業分散、顧客基盤、販売網、M&A統合力により、単一技術リスクを抑えやすい構造です。

配当重視

配当重視では、どちらも高配当株ではありません。Illuminaは無配、Thermo Fisherも利回りは低めです。両社とも配当より、成長投資、M&A、自社株買いを重視する銘柄です。

バリュー重視

PERだけ見るとThermo FisherのほうがIlluminaより低めです。ただし、Thermo Fisherは巨大企業で成長率はややマイルド、Illuminaは専門特化で成長期待が大きい分、評価の揺れも大きいです。

⑫ この比較の面白さ

この比較の面白さは、同じライフサイエンス領域でも、ビジネスモデルがかなり違う点です。

Illuminaは、ゲノム解析の中核技術を押さえる専門企業です。シーケンサー、消耗品、解析基盤の連動が強みです。

Thermo Fisherは、研究・診断・製造・臨床試験のインフラを広く押さえる総合企業です。顧客の研究開発予算の複数箇所から収益を得ます。

専門技術に賭けるIlluminaか、研究インフラ全体を押さえるThermo Fisherか。

この2社を比べると、ライフサイエンス投資の「尖った成長」と「広い安定」の違いがかなり見えやすくなります。

記録データ

Illumina

• ティッカー：ILMN

• 上場市場：Nasdaq

• 決算期：12月

• 会計基準：US GAAP

• 代表者：Chief Executive Officer Jacob Thaysen

• 直近決算：2026年12月期 第1四半期

• 株価：183.89ドル

• 時価総額：約283億ドル

• PER：33.0倍前後

• 1Q売上高：10.91億ドル

• 1Q売上成長率：4.8％

• GAAP営業利益率：19.2％

• Non-GAAP営業利益率：21.9％

• GAAP希薄化後EPS：0.87ドル

• Non-GAAP希薄化後EPS：1.15ドル

• 2026年通期売上見通し：45.2億〜46.2億ドル

• 2026年通期Non-GAAP EPS見通し：5.15〜5.30ドル

• 2026年1月：SomaLogic買収完了

Thermo Fisher Scientific

• ティッカー：TMO

• 上場市場：NYSE

• 決算期：12月

• 会計基準：US GAAP

• 代表者：Chairman and Chief Executive Officer Marc N. Casper

• 直近決算：2026年12月期 第1四半期

• 株価：513.33ドル

• 時価総額：約1,915億ドル

• PER：28.2倍前後

• 1Q売上高：110.1億ドル

• 1Q売上成長率：6％

• オーガニック売上成長率：1％

• GAAP営業利益：18.6億ドル

• GAAP営業利益率：16.9％

• Adjusted営業利益：24.0億ドル

• Adjusted営業利益率：21.8％

• GAAP希薄化後EPS：4.43ドル

• Adjusted EPS：5.44ドル

• 2026年3月：Clario買収完了

数値の出典

• Illumina「First Quarter 2026 Financial Results」

• Illumina「Management Team」

• Illumina「SomaLogic acquisition completion」

• Thermo Fisher Scientific「First Quarter 2026 Results」

• Thermo Fisher Scientific「Investor FAQs」

• Thermo Fisher Scientific「2025 Annual Report」

• Thermo Fisher Scientific「Clario acquisition completion」

• Grand View Research「Next Generation Sequencing Market, 2026-2033」

• Grand View Research「Life Science Tools Market, 2026-2033」

• Grand View Research「Analytical Instrumentation Market, 2026-2033」

• 2026年7月2日UTC前後の市場データ

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本記事は、企業分析・事業比較を目的とした情報提供であり、特定の金融商品の売買を推奨するものではありません。

掲載情報は作成時点で確認できた公開情報をもとにしていますが、正確性・完全性を保証するものではありません。

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おまけ：今日のひとこと用語解説

マルチオミクスって何？

マルチオミクスとは、DNAだけでなく、RNAやタンパク質など、体の中のいろいろな情報を組み合わせて見る考え方です。

たとえば、料理を味だけでなく、材料、作り方、栄養、香りまで見て理解するイメージです。

IlluminaがSomaLogicを買収したのは、ゲノムだけでなくタンパク質の情報も合わせて見たいからです。