【conda环境下如何安装rdkit】

文章目录简介功能准备安装参考 简介 RDKit 是用 C++ 和 Python 编写的化学信息学和机器学习软件的集合。 功能 BSD 许可证- 面向开源的商业友好型许可证 C++ 中的核心数据结构和算法 Python 3.x wrapper 使用 Boost.Python 生成 使用 SWIG 生成的 Java 和 C# 包装器 2D 和 3D 分子操作 用于机器学习的描述符和指纹生成 用于 PostgreSQL 的分子数据库盒，支持子结构和相似性搜索以及许多描述符计算器 用于 KNIME 的化学信息学

windows系统下载RDkit可以用anaconda，具体操作如下： conda install -c rdkit rdkit 然后就可以在python上运行。（我已经预先创建并激活了“python37”这个环境environment，默认是base，你们也可以创建使用python3.7的环境，方法在文末。） 如图，在anaconda的终端输入python，就会转换到python的编译环境。 尝试 import rdkit，没有报错~~ 展示一下我是如何创建并激活python37这个环

使用教程参考： https://sites.google.com/view/ml-basics/dealing-with-molecules 1、安装需要创立单独的python虚拟环境，前提需要提前安装好conda，可以后续方便jupter notebook使用 直接 ：conda create -c rdkit -n my-rdkit-env rdkit 激活：To activate thi...............

anaconda安装rdkit

RDKit 是用 C++ 和 Python 编写的化学信息学和机器学习软件的集合。

python3.8的环境安装rdkit的几种方法

一、安装anaconda 1. 下载Anaconda Linux版本 wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2021.11-Linux-x86_64.sh 或下载后上传至服务器 附下载好的百度云资源： 链接：百度网盘 请输入提取码 提取码：nuwq 2. 执行sh Anaconda*.sh 根据提示，依次输入yes，ENTER 3. 执行vi /root/.bashrc 用vi打开.bashrc文件，默认进入命令模式，输入“.

不创建虚拟环境的命令： conda install -c conda-forge rdkit 创建虚拟环境的命令： conda create -c rdkit -n my-rdkit-env rdkit

我的python版本是3.6，这里的conda是必须>=3.7，所以打断删除环境，重新建立一个python=3.8的版本。conda没法运行由于代理的错误，这个错误可能是由于在执行conda命令时，我们打开了代理导致的，可以关闭代理再次尝试，看看有没有问题。收集包失败，推测可能在conda-forge channel下没有这个包，或者没有适配的版本。2.添加豆瓣的conda-forge源，源是http还是https不确定。添加豆瓣源，从我的经验来看，豆瓣源确实快。然后再执行conda命令。

我是向gemini提问并按照它给的步骤安装成功的，在此记录一下安装过程。

第一步：创建自己的conda环境，并进入该环境 第二步：打开rdkit官网，找到对应的不同操作系统的rdkit库的指令，地址：Rdkit :: Anaconda.org 第三步：找到对应自己的操作系统，然后根据指令安装即可 conda install -c rdkit rdkitconda install -c rdkit/label/nightly rdkitconda install -c rdkit/label/attic rdkitconda install -c rdkit/label/be

RDKit 教程

去rdkit-pypi官网（https://pypi.org/project/rdkit-pypi/#description）找到对应版本的。ImportError: DLL load failed while importing rdmolfiles: 找不到指定的程序。除非修改python版本到较低版本如python3.7或python3.6，使用下面两种方法都是安装的之前版本的rdkit，找到对应版本的支持python3.8的安装指令。

vim使用命令 i 插入模式 ：wq 保存并推出 anaconda 换源 vim ~/.condarc channels: - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/ - https://mi...

python版本3.7情况下安装rdkit，torch_geometric，numpy的过程

一、RDKit包安装 　　1.安装RDKit包需下载安装Anaconda（下载网址：Anaconda | Individual Edition），具体安装方法上网可查。 　　2.安装成功后，在开始菜单可打开Anaconda Prompt命令窗口。 　　3.输入命令 conda create -c rdkit -n my-rdkit-env rdkit即可等待安装。 会提示镜像下载失败，太正常了，清华源就是这样 若安装失败，可采用以下两种方式解决： 　　　　1）使用命令conda ins.

【代码】RDkit | 安装报错及使用。

在运行相关github代码时，通常在import处需要导入rdkit,直接在Pycharm中点击install会出现错误，提示需要跳转官网，跳转官网复制指令安装提示python版本不匹配解决方案。