从单细胞测序到PCF80：TLS研究如何补充空间蛋白证据？

单细胞测序能够帮助研究者认识肿瘤微环境中的细胞组成和转录状态，但组织被解离后，细胞原本的空间位置和邻近关系会受到影响。三级淋巴结构（TLS）恰恰是一类高度依赖空间结构的免疫组织：B/T细胞如何分区、FDC网络在哪里、浆细胞是否向周边扩散，都需要在组织原位观察。PCF80作为空间单细胞蛋白组方案，可为TLS研究补充蛋白层面的空间证据。

近期，《Science》发表的一项题为“Pan-cancer spatial atlas of tertiary lymphoid structures”研究采用空间转录组构建全癌尺度分析，并结合PCF空间单细胞蛋白组、COMET和Xenium进行单细胞维度验证。研究显示，TLS可按成熟度分为E-TLS、P-TLS和S-TLS，并具有瘤内、瘤周、远端等空间定位差异。文献还提示，成熟TLS中不仅存在Tfh细胞富集，也可观察到Treg上调和调节性B细胞相关现象，反映TLS并非单纯“免疫攻击结构”，也包含免疫平衡相关成分。

PCF80可在这一研究框架下承担“空间蛋白验证与扩展”的角色。比如，单细胞测序或空间转录组提示某类T细胞、B细胞或髓系细胞与TLS成熟相关时，PCF80可用80抗体Panel在组织切片上验证这些细胞是否真的位于TLS内部或周边；同时结合蛋白标志物观察其活化、耗竭、调节、增殖等功能状态。这样可以减少只凭转录信息推断空间结构的局限。

PCF80可以在哪些研究课题中发挥左右？单细胞测序发现TLS相关细胞亚群后的原位验证；空间转录组识别TLS区域后的细胞分型；H&E或IHC提示TLS存在后的多标志物扩展分析；以及免疫治疗相关样本中TLS成熟度和细胞邻域的探索。需要注意的是，PCF80并不替代单细胞测序或空间转录组，而是从蛋白表达和空间位置层面提供互补证据。

因此，从单细胞测序到PCF80，并不是简单的技术升级叙事，而是研究问题发生了变化：从“有哪些细胞”进一步走向“这些细胞在组织中如何排列、如何相互靠近、处于什么功能状态”。对于TLS这类空间结构明显的研究对象，PCF80能够把80抗体Panel、组织原位成像和单细胞分析结合起来，帮助研究者形成更完整的空间免疫微环境证据链。

参考文献

Cho KS, Liu Y, Pei G, Chen J, Dai Y, Liu Y et al. Pan-cancer spatial atlas of tertiary lymphoid structures. Science. 2026;392(6801):eadz2742.