基因家族特征分析 - 染色体定位分析

1 染色体定位分析概念

  染色体定位分析是将基因家族成员在染色体上的位置标注出来，观察基因家族成员在染色体上是否成簇分布。

2 分析工具

2.1 MG2C(MapGene2Chromosome)

  MG2C是在线分析工具，网址如下：

http://mg2c.iask.in/mg2c_v2.0/

2.1.1 输入文件

  在页面上方有两个对话框，左边填入4列以制表符分隔的矩阵，从左到右，以此为：GeneID、起始位置、终止位置和染色体号，这些数据可由组装到染色体水平的注释文件得到。

2.1.2 输出结果

  点击DRAW按钮，就可绘图，生成图片可以导出为.svg格式，后续再利用Ai进行修改。

2.1.3 参数修改

  绘制的图片中，染色体id的字体、字号等细节通过页面左方的选项框进行修改。

2.2 TBtools

  TBtools是功能强大的图形化操作的基于Windows、Mac操作系统开发的生信分析软件，下方是文献引用的GB/T 7714格式。

Chen C, Chen H, Zhang Y, et al. TBtools: an integrative toolkit developed for interactive analyses of big biological data[J]. Molecular plant, 2020, 13(8): 1194-1202.

  文献的DOI为https://doi.org/10.1016/j.molp.2020.06.009

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