植物群体遗传学——初认识

群体遗传学（population genetics）：是遗传学的重要分支学科，是应用遗传学原理，采用数学、统计学以及其他学科（如：计算机科学），研究生物群体遗传结构及其世代间变化规律的科学，并由此探讨生物进化的机制。

A Mendelian population, defined as a group of individuals who reproduce sexually or are potentially capable of doing so, focuses on the evolutionary dimension and differs therefore fundamentally from other disciplines like general ecology or demography 

In the simplest of terms, a Mendelian population is a breeding group where random mating occurs, and Mendel’s principles of inheritance can be applied (Hartl & Clark, 1997). 

群体是指孟德尔遗传群体（mendelian population），是指在特定空间自由交配、繁衍的同种生物个体群，通过个体间相互交配，孟德尔遗传因子以不同方式方法从一代群体传递给下一代群体。这样才能通过相互交配而交流基因。最终，形成基因库（gene pool）。

孟德尔遗传群体常用于数量遗传学（quantitative genetics），也称统计遗传学（statistical genetics）。

Quantitative genetics is the study of the genetic basis underlying phenotypic variation among individuals, with a focus primarily on traits that take a continuous range of values. Some familiar examples include height, weight, and longevity.

数量遗传学基于表型变异在个体群中，首要关注的是那些连续变异范围的性状。比如说：株高，重量和生育期。

Quantitative Genetics - Evolutionary Biology - Oxford Bibliographies

Statistical genetics is the scientific discipline that focuses on the development and application of analytical methods to derive inferences from genetic data. When it is possible to collect phenotype and genotype data from a sufficient number of individuals who are affected by a suspected genetic disorder, a number of statistical approaches are amenable to quantifying the risk and statistical significance of putatively disease-causing variants. 

统计遗传学是科学规则，那些关注于从遗传数据推导出推论发育和应用分析方法。当有可能从足够数量的受疑似遗传疾病影响的个体中收集表型和基因型数据时，许多统计方法都可用于量化推定致病变异的风险和统计学意义。

Statistical Genetics - an overview | ScienceDirect Topics

Statistical geneticists at SPH develop statistical methods for understanding the genetic basis of human diseases and traits.  These methods involve large-scale data sets from candidate-gene, genome-wide and resequencing studies, using both unrelated and related individuals. 

大数据与预测基因全基因组和重测序研究，用于相关和不相关的个体。

Statistical Genetics | Department of Biostatistics | Harvard T.H. Chan School of Public Health

遗传学和统计分析 |在 Scitable 学习科学 (nature.com)

同时，数量遗传学往往与evolution biology 相关，当然生物学离不开进化。 

数量遗传学，研究他们的变异规律，也就是说从数据中找到规律。他建立在多基因以效的基础上。讨论数量性状的世代平均数和基因型方差等参数估计方差，数量性状基因效应和染色体上的位置。

在1889年，Galton全面地总结了我相关性概念和回归分析方法。总结发现了一代比一代要更接近于群体平均值的概念。

1908年，Hardy提出著名的Hardy-Weinberg法则。

研究模型

数学模型

为了更好的研究选择、突变、迁移和遗传漂移对群体进化的影响，必须构建简单模型，如此方便进行定量地揭示群体进化规律。

理想的数学模型应包括显示植物群体所具有的全部基本特征因子，排除非特征因子。

应关注变异的生物学意义，而非为了数字而数字。

主要群体的遗传参数有：突变率（突变——选择平衡模型）、选择压（群体中等位基因频率因选择力作用随世代变化模型）、迁移率、基因流（不同群体重等位基因频率模型）、近交系数及子焦虑（混合交配模型）等。