钙蛋白酶Calpain酶切位点预测工具 —— GPS-CCD 1.0

  　DOG 1.0: Illustrator of Protein Domain Structures. 　Jian Ren, Longping Wen, Xinjiao Gao, Changjiang Jin, Yu Xue and Xuebiao Yao.   　Cell Research

本来今天想写关于载体构建的文章，每次写之前的习惯就是在微信各个公众号查查看，自己想写的主题在公众号有没有写过，相关的文章数量有多少。浏览下来，在文章中用来做载体构建引物设计的分子生物学软件有很多，比如Primer Premier 5，Oligo 6.0，Primer 3.0，DNASTAR，Vector NTI，SnapGene，你说哪个最方便，哪个最好用，没有绝对一说。单纯说PCR引物...

启动子的分析和预测 一、摘要 加深对基因启动子的理解和认知； 学会如何获取已知基因的启动子序列数据； 熟悉不同启动子分析软件的使用及其适用范围； 学会设计启动子克隆引物。 熟悉EPD和TransFac数据库的使用； 学会使用已知的启动子和转录因子TransFac的HMM模型，并能够独立编程，利用该HMM模型来计算鉴别未知启动子 二、材料和方法 1、硬件平台 处理器:Int...

生物信息学资料1，常用软件，酶切位点分析 2010-04-02 8:27 一、生物信息学软件简介 （一）分类 •单机分析软件，如：winplas •在线分析软件， 如：webcutter •生物学数据库，如：NCBI, DDBJ, EBI （二）意义 1.分析和处理实验数据和公共数据，加快研究进度，缩短科研时间。 2.提示、指导、替代实验操作，利用对实验数据的

转自 http://www.yelinsky.com/blog/archives/278.html 稍有修改 默认位点为“CCGG”。其他位点分析可修改脚本中的 my $site = ‘CCGG';和 my $n = 2; #!/usr/bin/perl -w use strict; use Getopt::Long; use Bio::SeqIO; my %opts; GetOptions...

　GPS 2.0, a Tool to Predict Kinase-specific Phosphorylation Sites in Hierarchy 　Yu Xue, Jian Ren, Xinjiao Gao, Changjiang Jin, Longping

Systematic study of protein sumoylation: Development of a site-specific predictor of SUMOsp 2.0. Jian Ren, Xinjiao Gao, Changjiang Jin, Mei Zhu, Xiwei Wang, Andrew Shaw, Longpi

 　CSS-Palm 2.0: an updated software for palmitoylation sites prediction 　Jian Ren, Longping Wen, Xinjiao Gao, Changjiang Jin, Yu Xue and

获中山大学卓越人才计划教师特别津贴

蛋白质乙酰化数据库 —— CPLA 1.0

蛋白质亚硝基化修饰位点预测工具 —— GPS-SNO 1.0

蛋白质硝基化修饰位点预测工具 —— GPS-YNO2 1.0

蛋白质磷酸化计算资源汇总

　GPS 2.0, a Tool to Predict Kinase-specific Phosphorylation Sites in Hierarchy 　Yu Xue, Jian Ren, Xinjiao Gao, Changjiang Jin, Longping W

获批国家自然科学基金面上项目（2010）