团队博客2：Alpha 阶段计划与分工

原创已于 2025-11-04 19:18:13 修改 · 863 阅读

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#软件工程

于 2025-11-04 19:17:48 首次发布

本阶段为 Cax 项目的 Alpha Sprint，我们的目标是在 10 个工作日内完成核心功能的开发与系统初步集成。

团队共有 4 名成员，每人每天投入 4 小时，预计总投入时间为 160 小时。整体工作拆解为 36 个任务单元（每项约 4 小时），并预留 1 天作为应急与质量保证时间。

项目背景
RaMAx 是我们为优化 Cactus 基因组比对流程而设计的轻量级 aligner，目标是在保持合理准确率的基础上，显著提升比对速度。该模块覆盖锚点发现、聚类、RaMesh 图构建与剪枝等环节，预计用于替代现有 Cactus pipeline 中计算开销最大的部分。

WBS ID	模块	任务描述	Assigned To	Est.
WBS-M1-01	准备	梳理输入输出规范、参数项及默认配置	张平路	4h
WBS-M1-02	基线	运行原始 Cactus 样例，建立准确率与耗时基准	江明轩	4h
WBS-M1-03	FM-index	明确所用索引结构及适配策略	张平路	4h
WBS-M1-04	遮蔽规则	定义重复区域的遮蔽策略与回调机制	江明轩	4h
WBS-M1-05	分片策略	构建双物种/多物种场景下的分片机制	张平路	4h
WBS-M1-06	锚点搜索	实现多线程调度与缓存机制	张平路	4h
WBS-M1-07	过滤规则	构建对角线过滤、位置约束等逻辑	张平路	4h
WBS-M1-08	聚类策略	聚类逻辑设计：滑窗、密度、分段等	张平路	4h
WBS-M1-09	图构建	从锚点组装子图的策略	江明轩	4h
WBS-M1-10	图扩展	比对图路径拓展与剪枝逻辑	张平路	4h
WBS-M1-11	图清理	合并节点、去冗余链接	江明轩	4h
WBS-M1-12	图合并	多比对结果的图合并逻辑	张平路	4h
WBS-M1-13	优化尝试	进行缓存优化、吞吐调优尝试	张平路	4h
WBS-M1-14	文档撰写	编写使用手册与参数配置说明	江明轩	4h

项目背景
为了降低 Cactus 工具链的上手门槛，我们设计并开发了一个简洁的图形界面 cax，帮助用户进行可视化配置、参数校验与运行监控，特别适用于教学和协作团队。

WBS ID	模块	任务描述	Assigned To	Est.
WBS-M2-01	界面交互	启动后进入统一入口，支持三种导入方式（命令粘贴 / 文件读取 / 快速模板）	田钦中	4h
WBS-M2-02	界面交互	支持错误即时反馈、ESC/Ctrl+C 中断、状态恢复	田钦中	4h
WBS-M2-03	计划预览	展示轮次、命令目标、是否启用加速的计划总览	田钦中	4h
WBS-M2-04	计划存取	支持保存计划至本地文件，并可重新加载	刘奕	4h
WBS-M2-05	加速控制	用户可自主勾选使用 RaMAx 加速的轮次	田钦中	4h
WBS-M2-06	命令编辑	支持查看与修改各轮次命令参数	田钦中	4h
WBS-M2-07	环境检测	启动时自动检测 GPU、版本、依赖等环境信息	刘奕	4h
WBS-M2-08	命令导出	支持导出「即将执行的命令脚本」以便在服务器运行	刘奕	4h
WBS-M2-09	执行模拟	提供流程模拟检查功能，确保无异常再执行	田钦中	4h
WBS-M2-10	日志输出	实时日志输出，失败时提示错误位置	刘奕	4h
WBS-M2-11	可观测性	支持总日志与步骤日志查看	田钦中	4h
WBS-M2-12	可视反馈	可视统计使用加速的轮次数	刘奕	4h
WBS-M2-13	错误提示	常见错误支持中文提示与修复建议	刘奕	4h
WBS-M2-14	上手引导	提供交互命令行的快捷提示，如退出、保存、运行格式	田钦中	4h
WBS-M2-15	快捷操作提示	界面底部始终展示退出/保存/运行等快捷键	田钦中	4h
WBS-M2-16	文档撰写	编写精炼的 README，实现 3 分钟快速上手	刘奕	4h

项目背景
本阶段聚焦用户在实际使用过程中的完整体验闭环：从图形界面中配置任务，触发 RaMAx 执行，并实时展示执行进展与结果。

WBS ID	模块	任务描述	Assigned To	Est.
WBS-M3-01	启动逻辑	由 GUI 生成并触发 RaMAx 命令执行	江明轩	4h
WBS-M3-02	日志协议	设计执行日志格式，明确步骤编号与状态信息	江明轩	4h
WBS-M3-03	实时日志	实时读取 stdout/stderr 并在 UI 更新	刘奕	4h
WBS-M3-04	结果反馈	展示最终结果路径，标明是否加速及耗时比较	江明轩	4h
WBS-M3-05	e2e 验证	用测试样例验证端到端执行流程是否正确	刘奕	4h
WBS-M3-06	使用文档	编写使用示例，指导用户完成完整流程	江明轩	4h

模块	总工时	主要贡献者	协助人员
M1：RaMAx 加速比对核心算法	14 任务 × 4h = 56h	张平路主导	江明轩协助
M2：cax 图形配置界面	16 任务 × 4h = 64h	田钦中主导	刘奕协助
M3：系统整合与交互验证	6 任务 × 4h = 24h	刘奕 + 江明轩	无额外协助

总计任务量：
56h (M1) + 64h (M2) + 24h (M3) = 144h
预留 buffer + QA + 文档统一整理： 160h - 144h = 16h

成员	分工模块	预计工时分布	总计工时
张平路	M1 主导	9 任务 × 4h = 36h	36h
江明轩	M1 协助 + M3 协作	5 任务（M1）+ 4 任务（M3）= 36h	36h
田钦中	M2 主导	9 任务 × 4h = 36h（M2 中主导项）	36h
刘奕	M2 协助 + M3 协作	7 任务（M2）+ 2 任务（M3）= 36h	36h
Total			144h