MONAI Label in 3D Slicer 案例2: 脊柱全段分割+ radiology app解析

MONAILabel in 3D Slicer 案例2: 脊柱全段分割

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导读

本系列涵盖从 3D Slicer 医学图像查看器的基础使用到高级自动分割扩展程序的内容(从入门到高阶!),具体包括软件安装、基础使用教程,自动分割扩展(totalsegmentator, monai label)快速标注数据。

在本系列第三部分中,我们在工作站上安装了  MONAILabel 服务端和 MONAILabel 3D Slicer 客户端。在第四部分内容中,我们从一个简单的腹部CT脾脏分割案例开始,介绍了monai label使用的一些基础用法。

接下来,会介绍更多monai label自动分割案例,尤其是使用monai bundle 和model zoo里面的分割模型。

本节重点:在这一节中,我们将继续介绍 monai label radiology app中的一个预分割模型segmentation_vertebra. 可用于全脊柱的分割,包括颈椎C1-C7, 胸椎TH1-TH12,腰椎T1-T5。最后再介绍radiology的其他应用

该系列之前的内容如下: 

part1: 3D Slicer-最强大的开源医学图像分割工具简要概述

part2: 快准狠!在3D Slicer中,使用Total Segmentator可在1分钟内分割全身117个器官(学会在3D Slicer中安装插件)

part3: 在3D slicer中使用MONAI Label 辅助提升标注速度-安装教程(安装MONAI Label服务端和客户端)

part4:  MONAI Label in 3D Slicer 案例1: 在腹部CT中 自动分割脾脏(第一个monai label使用案例,含最详细的使用教程)

如果你没看过系列之前的内容,以下是monai label一个简单的介绍

MONAI Label 是一个服务器-客户端系统,它利用 AI 促进交互式医学图像注释。它是一个开源且易于安装的生态系统,可以在具有单个或多个 GPU 的机器上本地运行。服务器和客户端都在同一台/不同的机器上工作。它与MONAI共享相同的原理。

MONAI Label 减少了注释新数据集的时间和精力,并通过不断从用户交互和数据中学习,使 AI 能够适应手头的任务。MONAI Label 允许研究人员和开发人员以用户的方式与他们的应用程序交互,从而不断改进他们的应用程序。最终用户(临床医生、技术人员和一般注释者)受益于 AI 的不断学习,并更好地理解最终用户试图注释的内容。

---------------      let's do it    -------------

step1: 激活环境

 
内容概要:本文是一份系统性的Go语言并发编程实战教程,通过构建一个可运行的并发URL健康检查器项目,全面讲解了Go中goroutine、channel、select、WaitGroup、Mutex、context、超时控制、worker pool、限流、错误收集和优雅退出等核心并发机制。文章从基础概念入手,结合代码示例与实战项目,深入剖析常见并发模式如Worker Pool、Pipeline、Fan-out/Fan-in,并指出典型陷阱及修复方法,最后提供增强功能与测试建议,帮助开发者掌握生产级并发编程的最佳实践。; 适合人群:已掌握Go基础语法,具备一定开发经验(工作1-3年)的后端或云原生开发人员;希望深入理解Go并发模型并提升高并发系统设计能力的工程师。; 使用场景及目标:① 学习如何正确使用goroutine与channel进行任务调度和数据通信;② 掌握context在取消、超时和请求链路追踪中的应用;③ 构建可控并发度的worker pool避免资源耗尽;④ 实现错误汇总、限流、优雅退出等生产级特性;⑤ 避免goroutine泄漏、死锁、数据竞争等常见问题。; 阅读建议:建议边阅读边动手实现文中的URL健康检查器项目,结合-race检测工具验证并发安全性,并尝试完成文末练习任务以深化理解;重点关注context传播、channel所有权、单一状态持有者等设计原则,在实践中体会“不要通过共享内存来通信”的Go哲学。
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