利用Python解决生物信息学问题
1. 简介
生物信息学是一个活跃的研究领域,它运用从简单到高级的一系列计算方法,从生物数据中提取有价值的信息。Python作为一种强大的编程语言,在生物信息学领域发挥着重要作用。接下来将介绍如何使用Python及其相关的软件生态系统来解决生物信息学中的各种问题,包括环境搭建、数据处理、分析和可视化等方面。
2. 作者与审校者介绍
- 作者 :Tiago Antao是一名生物信息学家,目前从事基因组学领域的工作。他曾是一名计算机科学家,后来转向计算生物学。他拥有葡萄牙波尔图大学科学学院的生物信息学硕士学位,以及英国利物浦热带医学院关于耐药疟疾传播的博士学位。博士毕业后,他在英国剑桥大学处理人类数据集,在英国牛津大学处理蚊子全基因组测序数据,之后在美国蒙大拿大学帮助建立生物信息学基础设施。目前,他在马萨诸塞州波士顿的生物技术领域担任数据工程师,并且是用Python编写的主要生物信息学软件包Biopython的合著者之一。
- 审校者 :
- Urminder Singh是一名生物信息学家、计算机科学家和多个开源生物信息学工具的开发者。他的教育背景涵盖物理学、计算机科学和计算生物学学位,包括美国爱荷华州立大学的生物信息学博士学位。他的研究兴趣广泛,包括新基因进化、精准医学、社会基因组学、医学中的机器学习以及为大型异构数据开发工具和算法。可以通过urmi - 21.github.io在线访问他的信息。
- Tiffany Ho在Embark Veterinary担任生物信息学助理。她拥有加利福
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