一文梳理常见的测序技术(部分结合GEO数据库)

中心法则

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中心法则，又称为分子生物体的中心教条，是生物体中遗传信息传递的基本顺序。其中DNA-DNA，DNA-RNA，RNA-蛋白质这三种传递方式是在大多数细胞中普遍存在的规律。在特殊情况下，也会出现RNA-DNA，RNA-RNA，DNA-蛋白质这三种传递方式。目前还没有证据显示存在传递可能性的为蛋白质-DNA，蛋白质-RNA，蛋白质-蛋白质这三种方式。

那么围绕着中心法则中的三大组成部分(DNA，RNA，蛋白质)，研究者们也开发出了众多测序技术。

转录组

转录组是什么

转录组在广义上是指生物体细胞内所有转录产物的集合，包括了信使RNA(mRNA), 核糖体RNA(rRNA), 转运RNA(tRNA)及非编码RNA(Non-coding RNA)。

其中mRNA在细胞中的比率约占1-5%，tRNA约占10-15%，rRNA约占80-85%，Non-coding RNA约占1%。

鉴于mRNA在转录过程中提供了重要的遗传信息，non-coding RNA在基因调控和细胞功能中发挥着多种重要作用，这两者也成为转录组测序最常见的测序对象。

目前常用测序手段：

高通量测序（Next-Generation Sequencing, NGS）

● RNA测序（RNA-seq）：用于分析全转录组，检测基因表达水平、可变剪接、基因融合等。在GEO数据库中RNA高通量测序被称为Expression profiling by high throughput sequencing。