【DGL】定义邻居采样器和数据加载器

原创 已于 2022-04-14 02:33:15 修改 · 3.9k 阅读 · 3
于 2022-04-14 00:25:37 首次发布
本文介绍了DGL库中如何通过邻居采样器进行图神经网络（GNN）的节点分类训练，重点讲解了MultiLayerFullNeighborSampler的使用方法，以及NodeDataLoader如何配合采样器进行小批量节点数据的处理和依赖图生成。
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dgl用户文档第六章（大规模图Minibatch）
图挖掘领域，新晋砖家 ☞ 未来可期，欢迎和静静一起学习交流吖
12-29 832
简介 本章前三节将介绍不同场景下训练GNN模型的随机方法； 后三节则是一些比较高级的话题, 对于那些想要开发新的采样方法, 新的GNN模块来适应Mini-batch训练的人来说是可以查阅的, 后三节介绍了在Mini-batch中将如何评估以及推断模型的性能; 1、如果图的规模很大, b比如有上百万乃至数十亿的边和节点, 则上一章中提到的训练方法就无法起效了: 假设一个L LL层的GCN, 隐层状态节点有H HH个, 然后在一张有N NN个节点的图上运行, 则需要至少O ( N L H ) O(N
【DGL】dgl邻居节点采样器MultiLayerNeighborSampler
yuxeaotao的博客
04-13 2781
dgl.dataloading.neighbor.MultiLayerNeighborSamplerhttps://docs.dgl.ai/en/0.6.x/api/python/dgl.dataloading.html?highlight=multilayerneighborsampler#neighbor-sampler基于 `dgl.dataloading.dataloader.BlockSampler` 采样器，通过多层 GNN 的邻居采样建立节点表示的计算依赖。 该采样器将使每个节点从每种边缘
【dgl学习】dgl.dataloader中链接预测任务的负采样方法neg_sampler详解
RachelLee6的博客
09-26 890
dgl.dataloader中链接预测任务的负采样方法neg_sampler详解
如何解决类似 module ‘torch.utils.data.dataloader‘ has no attribute ‘Dataloader‘ 这一类问题
qq_42119367的博客
11-18 8023
如何解决类似 **module 'torch.utils.data.dataloader' has no attribute 'Dataloader'** 这一类问题 问题分析问题解决 ) 问题分析 通过英文错误提示，我们可以知道，当我们在调用该 module ‘torch.utils.data.dataloader’（后面将该文件’torch.utils.data.dataloader’说成 dataloader.py文件）的 ‘Dataloader’ 函数时，发现并没有找到该函数，也就是说，在 data
基于GCN和DGL实现的图上 node 分类, 值得一看!!!
qq_25459495的博客
01-24 953
这里我们采用dgl官方实现的graphConv算子进行邻居节点信息的聚合，不进行邻居节点的采样。@欢迎关注微信公众号：算法全栈之路ifi!=0:returnh我们可以看到：这里的网络结构选择的是gcn。在上面的网络结构中，nn.ModuleList中放有2层的GraphConv卷积层，并在其中加入了dropout层。图卷基层之间也是可以加入dropout层的，和传统的深度学习DNN无任何区别。为了加深理解，我们可以重点关注下gcn模型的初始化参数以及输入输出参数。
GraphSAGE的一些理解以及一些模块的DGL的代码实现
2501_90253882的博客
01-17 568
本来想画个图来展现一层层采样的汇聚过程的，但是感觉好像有点过于复杂了，那就直接从最后一步的结果来理解也是可以的吧，DGL邻居采样能够根据gnn的层数来得出对应得结果，计算的时候，只需要对应得block参与对应层gnn计算即可，这样实现了minbatch的计算，使得超大图得以轻松的训练。
图神经网络22-DGL实战：针对边分类任务的邻居采样训练方法
yanqianglifei的专栏
07-12 2114
边分类/回归的训练与节点分类/回归的训练类似，但还是有一些明显的区别。 定义邻居采样器和数据加载器 用户可以使用和节点分类一样的邻居采样器 。 sampler = dgl.dataloading.MultiLayerFullNeighborSampler(2) 想要用DGL提供的邻居采样器做边分类，需要将其与 :class:~dgl.dataloading.pytorch.EdgeDataLoad...
【DGL教程】第6章 大图上的随机训练
zzy979481894的博客
04-25 3743
官方文档：https://docs.dgl.ai/guide/minibatch.html 对于有上百万甚至上亿顶点和边的图无法使用全图训练，需要使用随机minibatch训练 邻居采样方法 在每个梯度下降步骤中，如果要计算某个顶点第L层的表示，根据消息传递，需要计算其全部或部分邻居第L-1层的表示，又需要计算这些邻居的邻居第L-2层的表示……这一过程一直持续到输入层。这一迭代过程构造了一个依赖图，从输出到输入，如下图所示 DGL提供了一些邻居采样器和使用邻居采样训练GNN的方法 1.使用邻居采样的顶点分
PyTorch Geometric终极指南：10分钟构建你的第一个图神经网络模型
gitblog_00788的博客
07-26 439
还在为处理复杂的图结构数据而烦恼吗？PyTorch Geometric（PyG）作为PyTorch生态中的图神经网络专用库，让你能够像处理图像和文本一样轻松处理图数据。无论你是机器学习新手还是资深研究者，PyTorch Geometric都能提供统一的API和丰富的预建模型，让你在几分钟内开始图神经网络的开发之旅。🚀 ## 为什么选择PyTorch Geometric？ PyTorch Ge
避开这5个坑！图神经网络推荐系统落地避雷指南
weixin_29050271的博客
03-11 90
本文针对图神经网络在推荐系统落地中的常见问题，提供了五大避坑指南。内容涵盖图构建、模型设计、社交与跨域推荐场景以及工程优化，重点分析了如何通过合理的邻居采样、异构图构建和负采样策略，解决内存爆炸与过度平滑等挑战，确保GNN模型从实验到线上服务的平稳高效运行。
图基础模型落地实战：拆解GFM工程化四层硬骨头
weixin_34121282的博客
06-25 427
图神经网络（GNN）作为处理关系型数据的核心技术，正从学术研究加速迈向工业落地。然而，当‘图基础模型’（GFM）概念兴起，其背后依赖的图结构建模、预训练任务协同、分布式扩展与微调适配等关键技术，并非简单套用大模型范式即可复现。尤其在真实业务图中——如金融风控拓扑、生物医药知识图谱或工业设备网络——稀疏性、异构性、小样本与动态性共同构成工程瓶颈。本文聚焦GFM落地中的关键挑战：图数据格式切换引发的显存碎片、多任务预训练的梯度冲突、超大规模图的邻居采样失真，以及微调阶段的结构-任务错配问题。通过GradNorm
【信息科学与工程学】【数据中心】 第二十七篇 AI领域各类通讯模式01
weixin_49199313的博客
12-29 708
类型业务特性数据要求数据Pipeline工作流程Pipeline应用场景限制条件机器学习​模式识别、预测分析、决策支持结构化数据、标注数据、特征工程数据采集 → 数据清洗 → 特征提取 → 特征选择 → 数据集划分问题定义 → 数据准备 → 模型选择 → 训练 → 评估 → 调优 → 部署推荐系统、风险评估、客户分群、销售预测依赖数据质量、过拟合风险、解释性差、需要持续更新深度学习​端到端学习、复杂模式提取、自动特征工程大规模数据、标注数据、图像/文本/语音数据增强 → 标准化 → 批处理 → 数据加载器架
LLM智能体驱动分布式GNN训练数据预取：Rudder方案解析与实践
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weixin_34082789的博客
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在分布式图神经网络（GNN）训练中，数据预取是优化I/O性能、提升GPU利用率的关键技术。传统预取方法基于顺序或启发式规则，难以应对GNN邻域采样产生的高度不规则数据访问模式，导致缓存命中率低、带宽浪费严重。其原理在于，GNN的采样过程受图拓扑结构影响，访问序列呈现长尾和突发特性，传统规则无法有效建模此类复杂依赖关系。Rudder方案的技术价值在于，创新性地引入轻量级大型语言模型（LLM）智能体，将数据块ID序列视为一种“语言”，利用Transformer的自注意力机制学习序列中的长距离依赖，从而精准预测未
PyTorch Geometric实战：构建工业级图神经网络解决方案
gitblog_01185的博客
07-01 484
你是否曾为处理社交网络、分子结构或推荐系统中的复杂图数据而头疼？当传统神经网络在非欧几里得数据结构上表现乏力时，图神经网络（GNN）成为了解决这类问题的关键技术。然而，从研究论文到生产部署，中间的技术鸿沟往往让开发者望而却步。PyTorch Geometric（PyG）作为基于PyTorch的图神经网络库，提供了从原型验证到大规模部署的完整解决方案，让图神经网络开发变得像传统深度学习一样简单高效。
PyG异构图处理实战：从RGCN到HGT的电商推荐系统构建
weixin_30432579的博客
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图神经网络（GNN）作为处理关系数据的核心技术，其核心原理在于通过消息传递机制聚合邻居信息，学习节点的低维表征。这种技术能有效捕获复杂关系，在推荐系统、社交网络分析等场景中价值显著。当图数据包含多种类型的节点和边时，便形成了异构图，例如电商场景中的用户、商品、品类及其多样的交互关系。PyTorch Geometric（PyG）框架为处理此类复杂结构提供了强大支持，其内置的HeteroData数据结构和RGCN、HGT等专用卷积层，使得开发者能够高效构建异构图神经网络模型。本文将以电商推荐为应用场景，深入解析
力扣解题思路：图 纠错记录
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785. 判断二分图 思路：给定一个无向图graph，当这个图为二分图时返回true。如果我们能将一个图的节点集合分割成两个独立的子集A和B，并使图中的每一条边的两个节点一个来自A集合，一个来自B集合，我们就将这个图称为二分图。graph将会以邻接表方式给出，graph[i]表示图中与节点i相连的所有节点。每个节点都是一个在0到graph.length-1之间的整数。这图中没有自环和平行边： graph[i] 中不存在i，并且graph[i]中没有重复的值。 举个例子： Input: [[1,3], [0,
第二十一课.DeepGraphLibrary(二)
白景屹的博客
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目录构建GNN模块官方SAGEConv和HeteroGraphConv用法 构建GNN模块 官方SAGEConv和HeteroGraphConv用法 在自主构建GNN模块前，先了解两个官方实现的GNN模块用法，首先学习 SAGEConv 的用法，GraphSAGE 来自论文 " Inductive Representation Learning on Large Graphs"，消息传递过程为：hN(i)(l+1)=aggregate({hj(l),∀j∈N(i)})h_{N(i)}^{(l+1)}=agg
Node DataLoader优化数据层
zdluoa的博客
07-24 717
作用： 1、批处理（将相同操作合并一起处理，减少与数据库的交互） 2、缓存（缓存查询对象，减少数据库查询，不过数据更新变动之后需清除缓存） 区别： 与Redis, Memcache, DataLoader实例是在请求开始时创建的，并且一旦请求结束， 就不会使用,数据不会被整个应用共享 使用： new DataLoader(batchLoadFn [, options])(创建一个lo...
DGL入坑
weixin_45606655的博客
05-26 906
DGL教学 文章目录DGL教学1. 数据集2. 图特征3. Graph Loader and Training4. 自定义图神经网络 DGL官方文档：https://docs.dgl.ai/index.html 1. 数据集 from dgl.data import DGLDataset class MyDataset(DGLDataset): def __init__(self, url=None, raw_dir=None,
tensorflow和keras搭建DNN、CNN、RNN手写数字识别
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MNIST手写数字集 　　MNIST是一个由美国由美国邮政系统开发的手写数字识别数据集。手写内容是0~9，一共有60000个图片样本，我们可以到MNIST官网免费下载，总共4个.gz后缀的压缩文件，该文件是二进制内容。 文件名 大小 用途 train-images-idx3-ubyte.gz 9.45MB 训练图像数据 train-labels...
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