5. DICOM图像层级分类-DCMTK-压缩图像PixelData读取

原创 已于 2026-01-21 07:04:12 修改 · 置顶 · 2.7k 阅读 · 2
标签
#dicom #计算机视觉 #图像处理 #c++ #vtk
于 2021-11-21 18:07:39 首次发布
本文介绍了如何使用DCMTK处理压缩的DICOM图像，包括JPEG、JPEG-LS等格式。当遇到JPEG 2000压缩格式时，由于DCMTK的限制，推荐使用GDCM进行解压缩后再用DCMTK读取。文中还提供了支持有损和无损解压缩的代码示例。

上篇文章讲解了dcmtk读取元素方式，但有局限性，只满足如下情况：

  1. 除PixelData外的元素
  2. 非压缩的PixelData

  如果dicom图像是压缩格式，则string pixelData = dcmParse.GetElementValue(DCM_PixelData);会报错，需要先将PixelData解压再读取。
  dcmtk提供两种开源解压模块，每种模块均支持无损压缩和有损压缩。
  dcmjpeg是jpeg压缩格式的图像编解码器，dcmjpls是jpeg-ls压缩格式的图像编解码器。
在这里插入图片描述
DJDecoderRegistration是dcmjpeg模块的解压注册类
DJLSDecoderRegistration是jpeg-ls模块的解压注册类
DcmRLEDecoderRegistration是dcmdata模块的解压注册类

void DcmParse::UnCompress
了解本专栏 订阅专栏 解锁全文 超级会员免费看
DCMTK：实现DICOM文件中RLE压缩数据的解压缩
2301_79366106的博客
08-24 331
其中， DcmRLEDecoder类提供了一种方法，可以将DICOM文件中使用RLE算法压缩的像素数据解压缩为原始像素数据。需要注意的是，在使用DcmRLEDecoder类解压缩像素数据时，需要将DICOM数据集作为参数传递给“decompress”方法，以便GDAL库可以正确地解释各种标记和标志。总的来说，使用DCMTK的DcmRLEDecoder类可以很容易地实现DICOM文件中RLE算法压缩像素数据的解压缩，避免了人们手动处理的繁琐过程。DCMTK：实现DICOM文件中RLE压缩数据的解压缩。
1.4 DICOM图像CT值计算
tianma2012的博客
11-07 3442
上一篇文章分析了如何解析DICOM图像，将内存中的数据按照DataElement提取出来，再根据DICOM图像类型提取成像相关的DataElement进行计算，最后将数据按照普通的RGB方式展现。 主要流程如图所示： 不同设备产生的DICOM图像像素格式不同，比如CT图像保存的是Hu值，超声（US）图像保存的是RGB值。 以最常见的CT图像举例： CT值的单位是Hounsfield，简称为Hu，范围是 -1024-3071，数据范围是4096。用于衡量人体组织对X射线的吸收率，设定水的吸收率为0Hu。 C
使用fo-dicom读取Dicom文件的PixelData信息及像素信息（C# / fo-dicom）
y18771025420的博客
07-30 6042
安装fo-dicom 在vs中安装fo-dicom 点击解决方案，右键选择管理解决方案的NuGet程序包 打开窗口后，在浏览框输入fo-dicom进行搜索，然后选着fo-dicom，勾选后点击安装即可 读取Dicom文件并获取PixelData信息 我是对一个文件夹中的多个Dicom文件进行遍历读取，也可以访问单个，自行修改 详细细节看代码以及注释，代码如下（部分代码可能需要根据自己的数据修改）： 使用的库文件，有些可能用不上 using Dicom; using Dicom.Imaging
DICOM标准中对PixelData的定义
dengqinglin2003的专栏
11-09 6099
对DICOM的多帧影像一直有个坎，总感觉有点不明白，看到了zssure的博客，很多疑问一下豁然开朗，虽解决了眼前的问题，但是对DICOM多帧影像的支持还需要深入研究，下面是我和zssure的一些感受，觉得他写的挺好的，就用了他的，希望对大家有点提示作用。 DcmPixelData字段（7FE0,0010）：         DICOM3.0标准第5部分第8章指出，如果数据以压缩
DCMTK：构建现代医疗影像系统的核心技术引擎
gitblog_00333的博客
04-16 715
DCMTK（DICOM Toolkit）是医疗影像领域的开源核心技术引擎，专为实现DICOM/MEDICOM标准而设计。它提供了完整的源代码、文档和工具集，帮助开发者快速构建可靠的医疗影像系统，支持从数据处理到网络通信的全流程需求。 ## 📌 什么是DCMTK？ DCMTK是一个功能全面的DICOM（数字成像和通信医学）工具包，包含多个子模块，每个模块专注于医疗影像处理的不同方面： - *
如何解析DICOM文件中的Pixel Data ?
anlz729的博客
04-03 1818
YBR_FULL_422 一般用于JPG有损压缩格式的彩**图像，每两个像素共同使用32位，每一个像素都有自己的Ｙ(Luminance 亮度)，但是共享相同的B(Blueness 蓝色)， R（Redness, 红色）。对于多帧图像，它是这样排列的：第一帧的RRR..，第一帧的GGG...，第一帧的BBB...,第二帧的RRR..，第二帧的GGG...，第二帧的BBB...每一个像素的取样数，一般来说，CT，MR，DR等灰度图像都是1，而彩超等彩**图像都是3，分别表示R, G, B三个颜色通道。
16位灰度数据成像_DICOM Pixel Data核心图像信息数据介绍
weixin_39970369的博客
01-03 2427
可以看到都从0028 group开始描述图像信息,讲述应该如何去阅读pixel，最终以7fe0,0010的地方开始存放PixelData,上面的是uncompressed file即未压缩的。下面这张图是compressed JPEG格式(压缩版)可以看到未压缩和压缩的一些细小差异：Photometric Interpretation(光度解释) - 压缩的用的是YBR_FULL_42, 未压缩的...
1.3 DICOM成像协议实现思路
tianma2012的博客
11-07 711
DCMTK和Dcm4chee等框架已经实现了DICOM协议解析，可以方便的读取DICOM的Tag信息，从而显示DICOM图像。但这些框架底层实现逻辑复杂，遇到不规范DICOM图像，可能解析失败，需要深入底层源码查找问题。而如果对DICOM协议了解不够深入和全面，则定位问题、修改bug会比较费劲。 因此手写一个简单的DICOM成像解析引擎，对理解DICOM协议底层实现会有很大的帮助。 前面说过，DICOM 文件一般由一个DICOM 文件头和一个DICOM 数据集合组成。 因此，DICOM成像协议实现
TensorFlow医学影像AI工作流：从DICOM到可核对分割热力图
06-16 312
医学影像AI的核心挑战并非模型结构，而是如何将原始DICOM数据可靠、可复现地转化为模型可用的张量。本文围绕MRI扫描这一典型高维、多序列、强临床约束的影像模态，解析TensorFlow原生DICOM解析（tf.io.decode_dicom_image）、窗宽窗位动态校准、序列级Z轴排序与像素间距适配等关键原理；强调数据管道可控性带来的临床价值——确保每步输出均可被放射科医生肉眼核对；覆盖预处理→标准化→推理→3D可视化全链路，并天然支持PACS集成与医生反馈闭环。适用于算法工程师规避DICOM工程陷阱，
构建临床可用的新冠CT影像大型数据集：从DICOM到标注的全链路实践
最新发布
weixin_33695450的博客
06-17 394
医学影像数据集是AI辅助诊断的基石，其核心在于临床真实性与技术规范性的统一。CT扫描作为新冠肺炎早期筛查的关键模态，需依托原始DICOM序列、病原学确诊金标准及三维体素标注，才能支撑SARS-CoV-2识别等高精度任务。高质量数据集不仅要求千例级规模，更强调多中心、多设备、多病原体的维度完备性，并满足FAIR原则与BIDS格式兼容性，从而成为可直接接入PyTorch或MONAI的‘算法燃料’。在基层医院部署、FDA/CE认证验证、跨机构模型泛化等真实场景中，数据质量直接决定AI系统的敏感性、特异性和临床采纳
QT DICOM医疗影像转换
老狼的专栏
05-31 1040
1、引言：借助开源库DCMKT进行转换。
DICOM基础知识--有用资料
Sayesan的专栏
03-12 5079
DICOM文件可以大致分为两部分： 一部分：与图像相关的元信息，包括患者信息，检查信息，序列信息，图像信息等等。 另一部分：图像的像素数据。 在解析DICOM文件中的像素数据的时候，我们先需要读取以下图像相关信息： 以下是某个CT影像中的图像信息示例： (0028,0002)        Samples per Pixel               VR: US        L
dicom 像素信息相关Tag解析
澜梓的博客
03-05 1218
像素信息
医学影像知识（一）：DICOM影像文件参数：窗宽窗位
ARYAD的博客
08-24 4924
较大的窗宽意味着更宽广的灰度范围，可以显示更多的细节，但可能在图像中丧失一些对比度。较小的窗宽则会强调图像中的细微灰度变化，但在图像的范围内可能丢失了一些细节。窗宽窗位是医学影像处理中不可或缺的概念，通过调整灰度范围和中心，可以提高图像的对比度和清晰度。SOP实例UID（SOP Instance UID）： 唯一标识DICOM文件中的具体图像实例，每个图像实例都有一个独特的UID。采集设备信息（Equipment Information）： 描述了使用的影像设备的信息，包括制造商、型号、软件版本等。
DCMTK实现获取压缩后的pixel data(附完整源码)
希望我的博客，能帮上你解决学习中工作中所遇到的问题
03-01 326
DCMTK实现获取压缩后的pixel data(附完整源码)
dicom格式文件讲解（二）
热门推荐
专注 机器学习+人工智能
04-17 1万+
Detailed Description The class DcmPixelData stores different pixel representations identified by a type (the transfer syntax) and some representation parameters The three unencapsulated transfer sy
DCMTK-dcmdata-数据编码/解码库
itzyjr的专栏
10-25 1362
dcmdata一个数据编码/解码库和实用程序该模块包含用于管理DICOM数据结构和文件的类。它还支持DICOM存储介质所需的DICOMDIR文件。
dcmtk程序包简介
diqiucun666的专栏
09-02 5916
dcmtk程序包简介***该文简单列出了dcmtk程序包的简介，包括主要接口类的简单说明，可用工具以及一些例子。下一步工作准备详细分析每个程序包中的接口类功能，并结合源码和dicom文档分析其实现过程。Dcmtk程序包简介一、Config程序包-config目录下的文档：--config.txt:指出你编辑的任何.h .c .cc文件首先必须包含该目录下的头文件#include
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

OneFlyPig

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付：¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足，请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值