3、公共生物信息数据库在医学中的应用

公共生物信息数据库在医学中的应用

1. 基因组数据库的应用

随着人类和其他物种完整基因组序列的获取，对基因组序列的详细分析无疑将增进我们对生物系统的理解，公共数据库成为了非常有用的工具。然而，由于基因组序列对生物技术和制药行业来说是潜在的利润来源，许多私人公司试图限制对这些信息的访问。这引发了关于公共和私人部门在基因组研究中角色的争议，以及私人占有基因组信息谁将受益、谁将受损的问题。

1.1 公共数据库工具

许多基于基因组数据库的公共工具已经被开发出来，以下是一些常见的工具及其应用：
| 工具 | 应用 |
| — | — |
| MICheck | 能够快速验证先前发表的细菌基因组中注释基因集和移码情况，通过网络界面可轻松查看结果，以图形方式展示独特编码DNA序列注释或预测移码的基因组背景 |
| Pegasys | 包含用于成对和多序列比对、从头基因预测、RNA基因检测、屏蔽基因组DNA中重复序列等工具，还可用于数据库格式化和处理各种分析工具的原始输出，帮助生物学家和生物信息学家创建和管理序列分析工作流程 |
| PartiGene | 是一个集成的序列分析套件，可将原始色谱图处理为适合提交到dbEST的序列对象，将这些序列置于基因组背景中，对数据进行可定制的初步注释，并以HTML表格和SQL数据库资源的形式呈现数据，已用于创建多个非模式生物数据库资源 |

1.2 基因组研究进展

进入后基因组时代，随着完整基因组序列的加速获取、新的理论方法和实验技术的出现，我们在分子水平上剖析细胞过程的能力不断增强。最近的进展包括：
1. RNA干扰方法的应用