
这段 R 代码主要是为 CellChat 进行细胞通讯分析做准备,具体作用如下:
代码解析
library(CellChat)
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加载 CellChat 包,这是一个用于 单细胞转录组数据的细胞-细胞通讯分析 的 R 包。
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主要用于推断和可视化不同细胞类型之间的配体-受体相互作用。
library(patchwork)
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加载 patchwork 包,作用是 方便组合多个 ggplot2 图形,通常用于可视化 CellChat 结果时的拼图。
options(stringsAsFactors = FALSE)
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设置 R 的全局选项,使 字符串不会自动转换为因子(factor)。
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这样可以避免数据在某些操作中被误转换成因子类型,减少数据类型相关的错误。
# reticulate::use_python("/Users/suoqinjin/anaconda3/bin/python", required=T)
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这一行被 注释掉(
#)。 -
作用是


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