(一)BSA基本概念
BSA即集群分离分析法,是Bulked-Segregant Analysis的首字母缩写。具体是利用差异目标性状的两个亲本构建家系,在子代分离群体中选取目标性状个体构建DNA混合池,采用高通量测序技术对混池DNA进行建库测序,开发全基因组范围内的SNP、InDel分子标记,以通过计算SNP、InDel的基因型频率,在基因组范围内检测与目标性状相关联的位点与基因,然后对候选基因进行功能注释,进一步探究控制目标性状的基因及其分子机制。

(二)BSA整体实验+测序分析策略
BSA分析是对分离群体极端个体混池进行深度重测序,定位候选区间。适用于参考基因组中等或者较小的物种。
BSR是将BSA与RNA-seq结合起来的分析方法,是对分离群体极端性状的个体,分别提取两个池的总RNA,进行RNA-seq。由于基因只占基因组的1-3%,BSR更适用于基因组较大的物种,比如麦类物种。

(三)派森诺BSA优势-有六种分析方法适用不同群体方案
BSA诞生至今,其关联算法也逐渐演变和分化。根据不同的遗传群体材料和遗传设计,有针对自然群体的Δ(SNP-index)、有针对EMS诱变材料的MutMap法(Abe et al., 2012)、针对无亲本只有两个极端混池的欧氏距离法(ED)(Hill et al., 2013)、基于一个大的F2群体并依据表型分组(三组以上)的GradedPool-seq(GPS)法(Wang et al., 2019)和较复杂的遗传设计QTG-seq法(Zhang et al., 2019a)等;


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