本文详细介绍了蛋白质受体的准备过程，包括使用ProteinPreparation模块处理可变残基，以及通过ReceptorGridGeneration模块生成受体分子格点文件。此外，还涉及到了LigPrep模块下的配体准备和Ligand-Docking模块的对接操作。最后，讨论了如何评估对接结果，并强调了分数负值与对接效果的关系。
1.准备受体
最好直接从
File>>Get PDB输入PDB ID获取。因为原始pdb文件保留了蛋白完整序列信息，这样在准备蛋白时薛定谔可以自动补全缺失残基。
选择
Protein Preparation模块。按照下图操作：
在正常准备蛋白的步骤中弹出了蛋白质中一些位置可变的残基（如下图所示），选中任意一种残基，点击next position会展现出这个残基可能的其他构象，点击commit即选定这个位置，表格中的数字表示这种位置的残基可能的概率大小，当所有残基都commit后，再点击update，将选定的这一组氨基酸的定位给固定下来（当然每个残基要选哪一个残基要靠自己的判断进行适当的取舍，对于不在活性口袋的可变残基可忽略其可变的位置。）
2. 生成受体分子格点文件
选择
recep
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