11、基于不变式改进静态变量顺序

基于不变式改进静态变量顺序

在符号状态空间生成算法中,选择一个好的变量顺序对于提高算法效率至关重要。本文提出了一种新颖的静态排序启发式方法,该方法考虑了Petri网的位置不变式,通过合并决策图变量而非消除它们,有效提升了算法的时间和内存效率。

1. 引言

Petri网是一种用于指定并发和分布式系统的流行形式化方法,对其状态空间的自动化分析一直是研究热点。许多分析技术依赖于生成和探索网的可达标记,常用的方法有基于决策图的算法和基于位置不变式的算法。

决策图虽然使研究人员能够研究具有数千个位置和转换的实际网,但它的性能很大程度上取决于底层的变量顺序。然而,找到一个好的变量顺序是一个NP完全问题,因此人们提出了许多静态或动态排序的启发式方法。

在Petri网的状态空间探索中,位置不变式可用于近似状态空间,以及通过利用功能依赖来紧凑地存储标记。以往的研究希望通过消除一些变量来获得更小的决策图,但本文指出这种做法可能会适得其反。

本文的贡献主要有两点:
- 证明了基于不变性信息消除变量可能会增加决策图的大小,而合并变量则能保证得到更小的决策图,并且可以提高事件局部性。
- 提出了一种适用于Saturation算法的静态变量排序新启发式方法,该方法结合了以往仅考虑事件高度和跨度的思想,以及基于线性位置不变式的变量合并。通过大量的基准测试表明,该启发式方法在时间和内存效率上都优于忽略位置不变式的方法。

2. 预备知识
2.1 Petri网和自修改网

本文考虑带有抑制弧的自修改网,用一个元组 $(P, T, F^-, F^+, F^◦, m_{init})$ 来描述:

随着人类对生命健康需求的不断增长,新药研发面临着前所未有的挑战。传统的药物研发流程通常耗时长达十年以上,耗资数十亿美元,且最终成功率极低,这在制药界被称为“反摩尔定律”困境。近年来,人工智能技术的飞速发展,特别是深度学习大数据分析的广泛应用,为新药发现带来了革命性的契机。人工智能能够从海量的化学生物数据中挖掘潜在规律,显著加速药物靶点发现、先导化合物优化等关键环节。在此背景下,本研究旨在设计并实现一个基于人工智能的新药发现辅助系统,以期为传统药物研发流程提供高效的智能化辅助工具,从而有效缩短研发周期并大幅降低研发成本。本研究以Python作为主要开发语言,深度结合PyTorchTensorFlow两大主流深度学习框架,并集成RDKit化学信息学工具包,构建了一个功能完善的新药发现辅助系统。系统的核心目标是利用先进的人工智能技术辅助新药分子的设计与活性评估。在研究方法上,本文创新性地提出了一种融合多模态数据的新药发现算法。该算法综合处理分子的多种表示形式,包括一维的SMILES序列、二维的分子结构以及三维的空间构象数据。通过构建多通道神经络,系统能够有效提取并融合不同模态的特征,从而全面捕捉分子的理化性质与生物学活性之间的复杂非线性关系。 【课程报告内容】 摘要 第1章 绪论 第2章 相关技术与理论 第3章 系统需求分析 第4章 系统总体设计 第5章 系统详细设计与实现 第6章 系统测试与分析 第7章 总结与展望 参考文献 附件-实现指南
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