快速稀疏块循环矩阵向量积的优化与实现
在许多科学计算和工程应用中,稀疏矩阵向量积(SpMV)是一个常见且关键的操作。对于块循环矩阵,通过一些优化技术可以显著提高SpMV的性能。本文将详细介绍这些优化技术以及在多核CPU和GPU上的实现。
基本稀疏 - 稠密矩阵乘法
给定稀疏矩阵 $A \in R^{m×n}$ 和稠密矩阵 $X \in R^{n×k}$,目标是计算它们的乘积 $Y = AX$,其中 $Y \in R^{m×k}$。通用的稀疏 - 稠密矩阵乘法算法如下:
Data: A : Rm×n sparse matrix; X : Rn×k, dense matrix
Result: Y : Rm×k, dense matrix with the product AX
1 Y ←0
2 for i ←0 to m −1 do (in parallel)
3
foreach nonzero with column index j and value v in row i of A do
4
for p ←0 to k −1 do // Done as an AXPY
5
Y[i, p] ←Y[i, p] + v · X[j, p]
这个算法的核心思想是遍历稀疏矩阵 $A$ 的每一行,对于每一个非零元素,将其与稠密矩阵 $X$ 对应列的元素进行乘法运算,并累加到结果矩阵 $Y$ 中。
数据存储与处理
如果稠密矩阵按列存储(即同一列的元素在内存中连续),可以利用 $\tilde{X}$
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