Leetcode Repeated DNA Sequences

最新推荐文章于 2016-06-11 17:20:16 发布

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本文介绍了一种基于哈希映射的DNA序列重复性检测算法，通过将DNA序列转换为整数并利用位操作来高效查找重复子序列。

class Solution {
private:
    unordered_map<char,int> hash;
    unordered_map<int,char> revert;
    string retrieve(int ans){
        string ret = "";
        for(int i = 0; i < 10; i++, ans >>= 2){
            ret += revert[ans & 3];
        }
        return ret;
    }
public:
    Solution(){
        hash['A'] = 0;revert[0]='A';
        hash['C'] = 1;revert[1]='C';
        hash['G'] = 2;revert[2]='G';
        hash['T'] = 3;revert[3]='T';
    }
    vector<string> findRepeatedDnaSequences(string s) {
         vector<string> ansSet;
         unordered_map<int,int> stringSet;


         int ans = 0, size = s.length();
         
         for(int i = 0; i < 10; i++){
             ans |= (hash[s[i]]<<(2*i));
         }
         
         stringSet[ans]++;
         
         for(int i = 10; i < size; i++){
             ans = (ans >> 2) | (hash[s[i]] << 18);
             if(stringSet[ans] <= 1){
               if(stringSet[ans] == 1){
                  ansSet.push_back(retrieve(ans));
               }
               stringSet[ans]++;
             }
         }
         
         return ansSet;
    }
};