深入浅出原核基因表达调控(乳糖操纵子、色氨酸操纵子)

文章详细介绍了原核生物基因表达调控的过程,主要包括转录水平和翻译水平的调控。通过乳糖操纵子和色氨酸操纵子的例子,阐述了负转录调控和正转录调控,以及诱导和阻遏的概念。此外,还讨论了细胞如何通过操纵子结构,如启动子、操作子和调控基因,以及活化蛋白和阻遏蛋白的作用,来适应环境变化并高效利用资源。

原核基因表达调控

前言

自然界里,能量时有时无,各种生命为了让自己能够活下去,需要适应环境,在不同的环境合成不同的蛋白质。

原核生物体内有很多细胞,细胞里面有很多蛋白质,但是这些蛋白质在这些细胞里的个数(拷贝数)因细胞而异。有的蛋白质的数量在不同的细胞中都相差不大,而有一些则波动很大。

我们把变化不大的蛋白质叫做组成型(constitutive)合成蛋白质,其合成速率不受环境变化或代谢状态的影响。为什么叫组成?大家想,如果组成变了,那细胞不也玩完了。而另一类就是适应型或调节型(adaptive or regulated)合成蛋白质,其合成速率明显收环境影响而变化。

Constitutive:糖酵解体系的酶、DNA聚合酶、RNA聚合酶等细胞代谢过程和生长发育过程中必需的蛋白质。

Adaptive/Regulated:其他参与糖代谢的酶和氨基酸、核苷酸合成系统的酶类。

细胞中的调控体系一般有这样的规律:需要时打开,不需要时关闭。这种“开-关”(on-off)机制是通过调节基因转录来建立的。注意了,当我们说这个系统处于“关”的状态时,也可能会有本底水平的基因表达,一般是每世代每个细胞之合成1或2个mRNA和极少量的蛋白质。这个“关”不是说这个基因不表达,而是其表达量特别低,低至很难甚至无法检测到。

  • 中文名

    本底

  • 外文名

    background

  • 含 义

    没有进样时检测器的信号值

原核基因表达调控总论

基因表达(gene expression)是从DNA到蛋白质的过程,对这一过程的调节也就被称为基因表达调控(gene regulation 或 gene control)。基因表达的调控是为了“活下去”和“长起来”。

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图1 基因表达

基因表达调控,主要是在两个阶段进行:

  1. 转录水平上的调控(transcriptional regulation)
  2. 转录后水平上的调控(post-transcriptional regulation)
    1. mRNA加工成熟水平上的调控(differential processing of RNA transcript)
    2. 翻译水平上的调控(differential translation of mRNA)

基因调控的指挥系统也是多样的,不同的生物使用不同的信号来调控基因表达。原核生物中,营养状况(nutritional status)和环境因素(environmental factor)对基因表达起着举足轻重的作用。真核生物则不一样,尤其是高等真核生物中,激素水平(hormone level)和发育阶段(developmental stage)是调控基因表达的最主要因素,营养和环境因素的影响力大为下降。

转录水平上的调控取决于DNA的结构、RNA聚合酶的功能、蛋白质因子和其他小分子配基的相互作用。在研究转录和转录调控前,我们先看看原核和真核生物转录和翻译的特点。

因为原核细胞没有细胞核,mRNA边合成边结合核糖体,所以,原核细胞的转录与翻译过程几乎同时发生,即转录与翻译相偶联(coupled transcription and translation)。而在真核生物中,转录产物(primary transcript)需要从细胞核内转运到细胞核外,才能被核糖体翻译成蛋白质。

原核生物只存在一种RNA聚合酶参与转录,而真核生物中有3种RNA聚合酶参与(高等植物如水稻种存在RNA聚合酶Ⅳ和Ⅴ,属于RNA聚合酶Ⅱ的同源基因)。

而对于转录后水平的调控,原核生物的蛋白质合成与甲酰-甲硫氨酸(tRNAMet),并且在起始AUG序列上游存在一段富含嘌呤的SD序列(AGGAGGU),促进翻译起始。在真核生物中不存在SD序列,并且蛋白质的合成起始于非甲酰化的甲硫氨酸(tRNAiMet)。

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图2 SD序列和16S rRNA上的anti-SD序列结合

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图3 起始氨基酰tRNA与小亚基结合

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图4 真核生物的Met-tRNAMet不甲酰化

原核基因表达调控分类

原核生物的基因表达调控主要发生在转录水平上,根据调控机制的不同可分为:负转录调控(negative transcription regulation)和正转录调控(positive transcription regulation)。在负转录调控系统中,调节基因的产物是阻遏蛋白(repressor),起着阻止结构基因转录的作用。正转录调控系统中,调节基因的产物是激活蛋白(activator),如果没有激活蛋白结构基因则不能转录。

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图5 正转录调控和负转录调控

调控还可以分成诱导(induction)和阻遏(repression)这两类。诱导是通过小分子诱导物参与,是阻遏物失活或活化激活剂来实现对基因或操纵子表达的调控。阻遏是通过小分子辅阻遏物参与,使激活剂失活或活化阻遏物来实现基因或操纵子不表达的调控。

我来总结一下:

  • 负控诱导:诱导因子和阻遏蛋白结合,使其变成非活性阻遏蛋白,这样就阻遏不了了,故基因表达;
  • 正控诱导:诱导因子和没有活性的激活蛋白结合,使其变为具有活性的激活蛋白,所以可以激活,故基因表达;
  • 负控阻遏:共阻遏蛋白和没有活性的阻遏蛋白结合,使其变为具有活性的阻遏蛋白,这样就可以阻遏了,故基因不表达;
  • 正控阻遏:共阻遏蛋白和有活性的激活蛋白结合,使其变为没有活性的激活蛋白,所以激活不了了,故基因不表达。

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图6 细菌中的转录调控体系

原核基因表达调控的主要特点

操纵子的调控

操纵子(operon):在原核生物中,一些结构基因可以串联在一起,其表达收到同一调控系统的调控,这种基因的组织形式成为操纵子。

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