FreeSurfer预处理命令

最新推荐文章于 2026-05-13 06:08:28 发布
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本文介绍如何使用Freesurfer工具包进行脑影像数据处理，包括解压缩文件、映射厚度、面积等属性到标准模板的过程。通过具体实例展示了不同属性（如厚度、面积、曲率等）的映射方法。

比如将/source/kernel.tgz解压到 /source/linux-2.6.29 目录
tar zxvf /source/kernel.tgz -C /source/ linux-2.6.29
tar zxvf /home/tj/application/freesurfer/subjects/mindboggle/OASIS-TRT-20-1.tar.gz -C /home/tj/application/freesurfer/subjects

(1)lh.thickness
mri_surf2surf --srcsubject OASIS-TRT-20-1 --sval thickness --src_type curv --trgsubject fsaverage5 --trgsurfval /home/tj/application/freesurfer/subjects/min_template/OASIS-TRT-20-1-target/thickness --trg_type curv --hemi lh

mri_surf2surf --srcsubject /3.11/HLN-12-2 --sval thickness --src_type curv --trgsubject fsaverage5 --trgsurfval /home/student8/application/freesurfer/subjects/3.11/mintemplate/HLN/thickness --trg_type curv --hemi lh

(2)lh.area
mri_surf2surf --srcsubject OASIS-TRT-20-1 --sval area --src_type curv --trgsubject fsaverage5 --trgsurfval /home/tj/application/freesurfer/subjects/min_template/OASIS-TRT-20-1-target/area --trg_type curv --hemi lh

(3)lh.sulc
mri_surf2surf --srcsubje

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