超级会员免费看
科学计算中的数据存储与线性代数库应用
1. HDF5 数据格式概述
Hierarchical Data Format 第五版（HDF5）是一种新兴的数据存储、检索和共享标准。它类似于 PDF 是可打印文档数字化的标准，RDBMS 用于关系数据的存储和检索，XML 是文档编码的可读标记标准，tar - zip 用于文件归档。HDF5 文件不仅可以存储数据，还能存储元数据，并且一个文件可以容纳任意数量的数据集。
其主要目的是将硬件层与用户分离，用户无需担心字节序、并行读写数据的最佳方式或特定硬件的问题，可专注于科学研究、金融分析等工作，由 HDF 组处理硬件相关的复杂任务。通过将数据写入 HDF 格式的文件，能确保不同硬件、操作系统和编程语言的用户都能读取该文件。HDF5 具有良好的未来兼容性，现在写入的文件在 10 - 20 年后仍可读取。虽然示例调用使用 Python 编写，但底层用于复杂内存访问的库是用 C 语言编写的，在 C 语言层面进行了性能优化，同时也支持并行 I/O 优化。
2. HDF5 的层次结构特点
扁平文件是很好的工具，结合标准的 POSIX 实用程序可以完成大量工作。但随着需求的提升，HDF5 能以灵活方便的格式，在单个可修改的文件中并行存储数字、图像、录音、视频、模拟结果等各种数字信息，并保证这些信息在后续可被读取。
HDF 使用层次化的 POSIX 路径语法，内部结构类似文件系统（如 “/path/to/data”），可以存储文件和其他数字对象（如照片、音频等），还能附加描述数据重要信息的属性或元数据，如数据的收集方式、温度等。
HDF5 成为重要文件格式并在研究界越来越受欢迎的原因在于，随着
订阅专栏 解锁全文
扫一扫
337
被折叠的 条评论
为什么被折叠?
到【灌水乐园】发言
