hg38 resource bundle google cloud download links

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This blog provides direct download links to the GATK hg38 resource bundle hosted on Google Cloud Storage, bypassing connection limits encountered on the Broad Institute's website. Access these files for genome analysis while requiring external network connectivity." 20744859,2552471,Cocos2d-x 引擎入门：CCApplication->run()解析,"['cocos2d-x', 'c++', '游戏开发']

https://software.broadinstitute.org/gatk/download/bundle  

通过GATK的resource bundle 下载hg38数据总是提示超过最大连接数（FileZilla）

搭上梯子去Google cloud 存储里，查找到这些文件的下载地址，不过还是需要能外网才能下载到，让我又怀念以前的VPN了

https://console.cloud.google.com/storage/browser/genomics-public-data/resources/broad/hg38/v0/

 

 

https://storage.googleapis.com/genomics-public-data/resources/broad/hg38/v0/1000G.phase3.integrated.sites_only.no_MATCHED_REV.hg38.vcf
https://storage.googleapis.com/genomics-public-data/resources/broad/hg38/v0/1000G.phase3.integrated.sites_only.no_MATCHED_REV.hg38.vcf.idx
https://storage.googleapis.com/genomics-public-data/resources/broad/hg38/v0/1000G_omni2.5.hg38.vcf.gz
https://storage.googleapis.com/genomics-public-data/reso

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GATK使用方法介绍-下载即用.zip
最新发布
02-19
源码下载地址： https://pan.quark.cn/s/f7e2d00bdac0 ### GATK操作指南全面解析#### 一、GATK功能概述及基础要求##### (1) GATK主要应用领域及版本迭代- **主要应用领域**：GATK主要应用于人类全基因组和外显子组测序数据的处理，且特别适配于illumina数据格式。尽管目前尚未兼容其他测序技术（如Ion Torrent）或实验方案（例如RNA-Seq），但其在人类基因组变异检测方面展现出卓越性能。- **版本迭代**：GATK作为一个持续更新的科研工具，定期进行错误修正和功能增强。最新版本为2.8.1（截至2014-02-25）。建议始终采用最新版本以获得最佳性能和官方支持。##### (2) 资源获取及安装方法- **官方下载路径**：官方资源获取页面位于http://www.broadinstitute.org/gatk/download。- **资源包**：GATK提供了一系列用于分析的人类基因组已知变异数据库，这些资源可以通过GATK的FTP站点下载，命名为GATK Resource Bundle。##### (3) 其他依赖组件- **R软件及其相关包**：为了执行部分绘图任务，GATK需要R软件的支持。确保安装了R以及以下必需的包：ggplot2、gplots、bitops、caTools、colorspace、gdata、gsalib、reshape、RColorBrewer等。在执行GATK过程中，若缺少某些包，系统会提示进行安装。#### 二、GATK标准操作流程GATK的常规操作流程包含三个核心阶段：1. **原始数据预处理**2. **变异识别**3. **初步分析**####...
下载GATK中存储的snp vcf文件
zbandzsxj的博客
08-01 4536
下载GATK中存储的snp vcf文件 写这篇文章的目的是为了以后不迷路，哈哈。我可以花了很长时间二次查找。 GATK是我们在找somatic snp时经常会用到的工具，它可以对可能存在小插入或者缺失的位点进行重新排列和校准! GATK里存储了很多版本的vcf文件 以下载hg38版本为例 网址为ftp://ftp.broadinstitute.org/bundle/hg38/ 我们可以在服务器上直接下载 wget -b -c ftp://gsapubftp-anonymous@ftp.broadinsti
如何下载、选择dbSNP数据库的变异位点vcf文件（hg19/hg38）
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GATK使用说明-GRCh38（Genome Reference Consortium）（二）
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Reference Genome Components 1. GRCh38 is special because it has alternate contigs that represent population haplotypes. Don’t know alternate contig from alternate dimension? Spend five minutes now t...
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[转]hg(Mercurial)使用参考 使用hg(mercurial)有好几个月了,个人感觉这款分布式的版本控制系统非常不错，易学，易用；你可以从做在你旁边的同事拉取完整的代码; 对网络的依赖性更低,有本地沙盒，真正实现了离线开发; 轻量；安全，不会因为一两个节点的损坏而影响整个系统。这里做下使用笔记，脑子不好使，容易忘。 安装： windows下的图形界面工具：http://to
hg 使用 教程（非常值得一看）
谨慎对事 低调行事 0与1的世界 浩瀚如海 学无止境
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原文地址：http://blog.csdn.NET/zxkln/article/details/6118572 GDC注：只要你从头看到尾（而且该篇文章确实引人入胜，一步一步教你如何做），就会对HG的使用有一个非常全面的了解。唯一不足的是这篇教程中没有谈到branch在开发中的使用，感兴趣的可以自己在看完该篇文章的基础上，上网搜一搜HG branch的用法，这样就完全够开发使用了。
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CTFHub技能树 Web-信息泄露 HG泄露 hit：当开发人员使用 Mercurial 进行版本控制，对站点自动部署。如果配置不当,可能会将.hg 文件夹直接部署到线上环境。这就引起了 hg 泄露漏洞。 启动环境： 其提示了为Mercurial的信息泄露，也就是/.hg泄露 提示flag在服务器端就版本中 有了SVN泄露的经验，直接使用dvcs-ripper下载.hg文件： ./rip-hg.pl -v -u http://xxx.com/.hg 打开.hg文件夹： 查看到其中有last-mes
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CTFHub-Web-信息泄露-HG泄露 flag寻找，dvcs-ripper使用
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1 ECLIPSE上插件市场搜索HG然后 下载 安装 重启ECLIPSE 2 使用HG插件下载 代码 关键点是 下载地址 比如 hg clone https://code.google.com/p/foursquared/ 那么下载地址就是https://foursquared.googlecode.com/hg/foursquared...
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